More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3151 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 243 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3372  OmpA/MotB domain protein  50.2 
 
 		 266 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363185  hitchhiker  0.00000000701335 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  55.08 
 
 		 234 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  51.05 
 
 		 267 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  41.7 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  42.28 
 
 		 239 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 		 242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  41.99 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  42.24 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  41.99 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  43.04 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.1 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.42 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  42.92 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  42.92 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  42.92 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  42.79 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.92 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  40.68 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  52.48 
 
 		 334 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  53.47 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6593  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.76 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  54.81 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  46.34 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  44.54 
 
 		 330 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  48.15 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  40.71 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40.91 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  46.6 
 
 		 326 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  45.97 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  41.28 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  41.09 
 
 		 207 aa  92.4  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  44.19 
 
 		 333 aa  92.4  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  40.28 
 
 		 337 aa  92.4  6e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  41.28 
 
 		 237 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  43.07 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 		 247 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  47.17 
 
 		 264 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  39.82 
 
 		 229 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  39.82 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  40.97 
 
 		 337 aa  90.5  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  39.83 
 
 		 187 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  46.9 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  46.9 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  46.67 
 
 		 375 aa  90.1  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  44.64 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  46.9 
 
 		 219 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  44.55 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  37.82 
 
 		 188 aa  89.7  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  46.02 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  44.35 
 
 		 345 aa  89.4  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 210 aa  89  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  38.13 
 
 		 231 aa  88.6  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 		 230 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  43.59 
 
 		 445 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.58 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  44.95 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  42.19 
 
 		 464 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  43.4 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  45.28 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 215 aa  86.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 230 aa  87  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  40.59 
 
 		 214 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  46.43 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  46.43 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  46.08 
 
 		 321 aa  85.9  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>