More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4592 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
296 aa  580  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  43.16 
 
 
263 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  43.16 
 
 
263 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  43.51 
 
 
262 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  42.81 
 
 
263 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  41.4 
 
 
260 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  40.7 
 
 
261 aa  196  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  41.4 
 
 
260 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  40.91 
 
 
331 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  42.86 
 
 
264 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  41.67 
 
 
286 aa  185  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  38.72 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  40.52 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  38.35 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  37.89 
 
 
270 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  35.19 
 
 
271 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  34.49 
 
 
271 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  34.63 
 
 
270 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  35.06 
 
 
270 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  37.37 
 
 
270 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  35.42 
 
 
270 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  34.8 
 
 
270 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  34.8 
 
 
270 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2254  outer membrane protein  36.64 
 
 
269 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.374257  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26560  putative outer membrane protein precursor  37.79 
 
 
269 aa  136  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.304401  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  38.97 
 
 
288 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  35.27 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  52.78 
 
 
218 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  53.4 
 
 
223 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  53.92 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  46.22 
 
 
205 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  50.91 
 
 
218 aa  112  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  52.94 
 
 
344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  52.94 
 
 
344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  52.94 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  47.5 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  53.92 
 
 
327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  52.94 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  52.94 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  51.96 
 
 
345 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  51.79 
 
 
407 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  51.96 
 
 
351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  44.78 
 
 
215 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  52.94 
 
 
344 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  39.39 
 
 
230 aa  109  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  52.94 
 
 
344 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  49.57 
 
 
240 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  47.97 
 
 
166 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  50.49 
 
 
321 aa  106  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  33.51 
 
 
656 aa  105  6e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0318  OmpA/MotB domain-containing protein  49.53 
 
 
174 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0137068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  50.98 
 
 
344 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  47.71 
 
 
222 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 
229 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  46.6 
 
 
233 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  50.47 
 
 
364 aa  104  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  47.06 
 
 
248 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  45 
 
 
219 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  42.34 
 
 
217 aa  102  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  36.48 
 
 
626 aa  102  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  48.51 
 
 
222 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  47.52 
 
 
337 aa  102  9e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  45.38 
 
 
206 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  41.61 
 
 
217 aa  102  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  45.38 
 
 
206 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  44.66 
 
 
229 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  48.51 
 
 
330 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  44.09 
 
 
209 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  38.35 
 
 
669 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  40.15 
 
 
225 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 
219 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  51.89 
 
 
230 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  52.34 
 
 
230 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  44.14 
 
 
623 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  51.89 
 
 
230 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  48.11 
 
 
319 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  48.51 
 
 
223 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  44.95 
 
 
222 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  40.91 
 
 
422 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 
219 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  48.6 
 
 
447 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 
218 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 
218 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  45.13 
 
 
263 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  35.44 
 
 
175 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 
1026 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  48.57 
 
 
417 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  41.23 
 
 
537 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  48.04 
 
 
434 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  48.65 
 
 
224 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  43.93 
 
 
318 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1220  OmpA/MotB domain protein  45.53 
 
 
168 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 
679 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  53.49 
 
 
219 aa  99.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  39.67 
 
 
510 aa  99.8  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  48.33 
 
 
222 aa  99.4  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 
242 aa  99  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  48.08 
 
 
217 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  48.08 
 
 
217 aa  99  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42.28 
 
 
230 aa  99  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>