More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04495 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  100 
 
 		 626 aa  1286    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  40.46 
 
 		 665 aa  434  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 666 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 653 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  38.03 
 
 		 643 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  37.79 
 
 		 642 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  36.59 
 
 		 650 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  35.46 
 
 		 660 aa  366  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  33.69 
 
 		 645 aa  345  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  35.25 
 
 		 630 aa  341  2.9999999999999998e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  35.7 
 
 		 712 aa  300  6e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 		 757 aa  280  8e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  31.7 
 
 		 668 aa  260  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  33.38 
 
 		 648 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  31.35 
 
 		 677 aa  256  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  30.66 
 
 		 656 aa  247  6e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  29.88 
 
 		 672 aa  245  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  30.31 
 
 		 613 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  31.6 
 
 		 671 aa  236  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.93 
 
 		 673 aa  225  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  40.94 
 
 		 798 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  29.39 
 
 		 903 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  30.02 
 
 		 813 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  31.38 
 
 		 631 aa  209  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  27.74 
 
 		 658 aa  206  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  29.49 
 
 		 620 aa  201  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  27.52 
 
 		 631 aa  193  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  31.64 
 
 		 630 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  31.9 
 
 		 638 aa  190  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  27.91 
 
 		 679 aa  189  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  31.39 
 
 		 734 aa  188  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  26.84 
 
 		 640 aa  188  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  33.72 
 
 		 585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  29.66 
 
 		 656 aa  182  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  26.78 
 
 		 710 aa  180  9e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  26.95 
 
 		 641 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  29.12 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  28.54 
 
 		 778 aa  156  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  27.84 
 
 		 712 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  29.14 
 
 		 537 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  26.68 
 
 		 471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  27.12 
 
 		 670 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  28.28 
 
 		 704 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  24.96 
 
 		 648 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  29.32 
 
 		 694 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  29.91 
 
 		 510 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  25.72 
 
 		 673 aa  127  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  26.65 
 
 		 525 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  29.16 
 
 		 517 aa  123  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  30.09 
 
 		 669 aa  115  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  31.22 
 
 		 340 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  28.93 
 
 		 586 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  33.01 
 
 		 594 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  39.44 
 
 		 424 aa  100  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.93 
 
 		 296 aa  99.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  29.25 
 
 		 519 aa  98.6  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  40.98 
 
 		 623 aa  97.8  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42.2 
 
 		 230 aa  95.5  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 360 aa  95.1  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  35.71 
 
 		 263 aa  94.7  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  35.96 
 
 		 429 aa  94.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40.8 
 
 		 240 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  44.86 
 
 		 454 aa  92.8  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 		 412 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 432 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  42.97 
 
 		 459 aa  92  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.14 
 
 		 447 aa  91.3  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.5 
 
 		 422 aa  90.5  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  40.18 
 
 		 466 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  37.39 
 
 		 1755 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.25 
 
 		 170 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 225 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  40.83 
 
 		 380 aa  89  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  31.55 
 
 		 293 aa  88.6  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  37.96 
 
 		 209 aa  88.2  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  36.92 
 
 		 344 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 209 aa  88.2  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  41.41 
 
 		 459 aa  87.8  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  42.99 
 
 		 233 aa  88.2  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 227 aa  87.4  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.37 
 
 		 321 aa  87.4  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.92 
 
 		 344 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  36.25 
 
 		 568 aa  87  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  41.6 
 
 		 427 aa  87  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.06 
 
 		 427 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  40.38 
 
 		 320 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 223 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  36.15 
 
 		 344 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  37.84 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  36.15 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  43.93 
 
 		 263 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  36.15 
 
 		 344 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  37.84 
 
 		 261 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  37.84 
 
 		 261 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  28.44 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  35.9 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3322  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 		 180 aa  84.7  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  38.94 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>