More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4115 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  66.54 
 
 		 537 aa  710    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 525 aa  1079    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  45.79 
 
 		 517 aa  476  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  42.41 
 
 		 510 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  44.18 
 
 		 694 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  43.23 
 
 		 670 aa  395  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  41.42 
 
 		 669 aa  371  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  39.53 
 
 		 704 aa  356  6.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 673 aa  345  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  34.21 
 
 		 641 aa  250  5e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  34.39 
 
 		 630 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  30.69 
 
 		 658 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  33.59 
 
 		 620 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  32.36 
 
 		 640 aa  230  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  31.8 
 
 		 631 aa  225  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  32.66 
 
 		 631 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  31.43 
 
 		 656 aa  209  1e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  29.19 
 
 		 638 aa  207  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.83 
 
 		 673 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  31.31 
 
 		 509 aa  192  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.02 
 
 		 671 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  26.49 
 
 		 648 aa  160  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  30.73 
 
 		 519 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  30.45 
 
 		 679 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  36.52 
 
 		 432 aa  143  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  27.27 
 
 		 903 aa  140  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  34.78 
 
 		 1313 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  25.78 
 
 		 643 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  27.91 
 
 		 656 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  33.2 
 
 		 427 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  29 
 
 		 668 aa  134  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  26.89 
 
 		 710 aa  133  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  37.66 
 
 		 412 aa  133  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  29.13 
 
 		 645 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  28 
 
 		 677 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  27 
 
 		 712 aa  130  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  30.39 
 
 		 660 aa  127  5e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  27.1 
 
 		 626 aa  126  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  25.09 
 
 		 666 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  25.67 
 
 		 653 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  47.5 
 
 		 374 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  26.01 
 
 		 665 aa  116  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  27.51 
 
 		 672 aa  113  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  25.69 
 
 		 642 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  40.94 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  46.73 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  24.76 
 
 		 650 aa  111  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  28.34 
 
 		 648 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  29.05 
 
 		 505 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  46.23 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  46.36 
 
 		 637 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  35.29 
 
 		 239 aa  106  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  29.18 
 
 		 585 aa  106  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 		 241 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  41.27 
 
 		 734 aa  104  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  49.52 
 
 		 478 aa  103  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  43.22 
 
 		 193 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 449 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  44.23 
 
 		 224 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  37.4 
 
 		 1026 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  45.19 
 
 		 294 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  40.5 
 
 		 320 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  32.2 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  23.99 
 
 		 798 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.52 
 
 		 440 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 364 aa  99.8  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  41.32 
 
 		 1755 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  40.32 
 
 		 594 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  44.83 
 
 		 224 aa  99  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  40.17 
 
 		 586 aa  98.6  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  48.11 
 
 		 221 aa  98.2  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 459 aa  97.8  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  44.76 
 
 		 220 aa  97.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  44.76 
 
 		 243 aa  97.4  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 360 aa  97.4  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  37.31 
 
 		 223 aa  97.4  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  30.7 
 
 		 320 aa  97.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.61 
 
 		 296 aa  97.1  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  44.23 
 
 		 402 aa  96.7  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  41.28 
 
 		 225 aa  96.7  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  43.86 
 
 		 286 aa  96.3  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 506 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 236 aa  96.3  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 		 543 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.91 
 
 		 707 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.74 
 
 		 542 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.85 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 222 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  41.88 
 
 		 221 aa  95.1  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  39.83 
 
 		 398 aa  95.1  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  36.69 
 
 		 230 aa  95.1  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  42.86 
 
 		 463 aa  95.1  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 729 aa  94.7  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  43.93 
 
 		 266 aa  94.7  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  40.16 
 
 		 510 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 218 aa  94.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 261 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 623 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 		 175 aa  94.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  42.74 
 
 		 217 aa  94  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>