More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2185 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  100 
 
 		 694 aa  1421    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  46.35 
 
 		 670 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  44.18 
 
 		 537 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  44.03 
 
 		 669 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  35.57 
 
 		 704 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  44.04 
 
 		 517 aa  405  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  39.41 
 
 		 673 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  44.18 
 
 		 525 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  39.96 
 
 		 510 aa  347  6e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  35.31 
 
 		 620 aa  277  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  36.33 
 
 		 630 aa  276  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  34.01 
 
 		 640 aa  256  7e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  33.26 
 
 		 631 aa  251  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  32.72 
 
 		 631 aa  250  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  32.53 
 
 		 641 aa  249  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  32.53 
 
 		 658 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  30.18 
 
 		 638 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  31.12 
 
 		 656 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.24 
 
 		 673 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  34.39 
 
 		 509 aa  211  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  28 
 
 		 671 aa  174  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  26.69 
 
 		 648 aa  169  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  29.32 
 
 		 519 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  30.67 
 
 		 668 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  28.16 
 
 		 679 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  30.53 
 
 		 665 aa  150  9e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  31.88 
 
 		 645 aa  148  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  35.93 
 
 		 432 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  28.45 
 
 		 648 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  23.77 
 
 		 712 aa  141  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 412 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  29.32 
 
 		 626 aa  139  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  26.87 
 
 		 656 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  27.45 
 
 		 630 aa  137  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  27.82 
 
 		 672 aa  136  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  27.09 
 
 		 677 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  26.78 
 
 		 643 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  27.96 
 
 		 903 aa  135  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  28.27 
 
 		 660 aa  134  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  35.22 
 
 		 427 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  25.59 
 
 		 653 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  27.14 
 
 		 650 aa  126  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  52.63 
 
 		 424 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  27.59 
 
 		 710 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 241 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  28.76 
 
 		 642 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  34.88 
 
 		 1313 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  48.11 
 
 		 440 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  32.74 
 
 		 505 aa  107  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.09 
 
 		 407 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  46.67 
 
 		 466 aa  104  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  47.12 
 
 		 464 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  49.5 
 
 		 463 aa  103  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  29.32 
 
 		 585 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  45.71 
 
 		 707 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  46.23 
 
 		 445 aa  103  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  41.13 
 
 		 594 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  43.48 
 
 		 537 aa  102  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  44.35 
 
 		 586 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 		 1755 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  31.22 
 
 		 798 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  38.64 
 
 		 229 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 364 aa  99  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  34.95 
 
 		 241 aa  99  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  40.83 
 
 		 422 aa  99.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  40.17 
 
 		 230 aa  99.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 543 aa  99.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 454 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 449 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  37.9 
 
 		 306 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  45.63 
 
 		 459 aa  98.2  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 440 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.19 
 
 		 542 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  38.89 
 
 		 734 aa  97.8  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 544 aa  97.8  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 1026 aa  97.8  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  42.34 
 
 		 331 aa  97.4  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 468 aa  97.1  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  45.05 
 
 		 327 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  45.79 
 
 		 417 aa  96.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  43.81 
 
 		 464 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 416 aa  96.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  42.99 
 
 		 388 aa  95.9  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 		 209 aa  95.9  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 		 459 aa  96.3  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  42.34 
 
 		 463 aa  95.5  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  49.02 
 
 		 466 aa  95.1  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  46.46 
 
 		 210 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  42.86 
 
 		 351 aa  94.7  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  48.04 
 
 		 457 aa  94.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  27.04 
 
 		 613 aa  94.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 		 464 aa  94  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.64 
 
 		 240 aa  94  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  45.61 
 
 		 376 aa  93.6  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.19 
 
 		 321 aa  93.2  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  44.64 
 
 		 344 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  42.86 
 
 		 344 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  43.64 
 
 		 375 aa  93.6  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  41.51 
 
 		 218 aa  93.6  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 		 375 aa  93.6  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>