More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3584 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
798 aa  1648    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  46.5 
 
 
813 aa  716    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  46.29 
 
 
757 aa  673    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  31.61 
 
 
666 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  28.78 
 
 
734 aa  302  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  29.09 
 
 
712 aa  285  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  30.68 
 
 
653 aa  284  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  32.21 
 
 
665 aa  280  7e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  32.49 
 
 
643 aa  261  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  30.58 
 
 
626 aa  238  3e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  30.46 
 
 
471 aa  217  9e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  27.79 
 
 
630 aa  213  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  28.06 
 
 
650 aa  209  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  27.82 
 
 
645 aa  204  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  31.01 
 
 
642 aa  204  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  33.47 
 
 
585 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  40.42 
 
 
660 aa  188  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.63 
 
 
673 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  32.1 
 
 
668 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  29.46 
 
 
677 aa  170  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  29.17 
 
 
648 aa  170  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  29.67 
 
 
613 aa  161  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  28.52 
 
 
641 aa  158  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  26.83 
 
 
656 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  33.85 
 
 
778 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  31.08 
 
 
672 aa  139  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  32.43 
 
 
658 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  27.9 
 
 
671 aa  137  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  27.92 
 
 
640 aa  134  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  30.67 
 
 
631 aa  134  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  26.91 
 
 
903 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  31.15 
 
 
630 aa  131  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  26.36 
 
 
638 aa  131  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  26.08 
 
 
537 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  26.4 
 
 
656 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  35.71 
 
 
519 aa  127  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  29.52 
 
 
631 aa  125  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  27.82 
 
 
620 aa  123  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  34.36 
 
 
340 aa  122  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  27.33 
 
 
679 aa  118  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  25.52 
 
 
712 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  23.99 
 
 
525 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  31.22 
 
 
694 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  26.23 
 
 
669 aa  97.8  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  44.83 
 
 
594 aa  97.8  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  23.89 
 
 
673 aa  97.4  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  33.54 
 
 
568 aa  97.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08086  hypothetical protein  41.96 
 
 
366 aa  95.5  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  42.74 
 
 
586 aa  91.3  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  38.69 
 
 
230 aa  89.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  38.6 
 
 
509 aa  89.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  30.77 
 
 
710 aa  89.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  23.75 
 
 
670 aa  89.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  40.68 
 
 
510 aa  87.4  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  31.96 
 
 
293 aa  86.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  23.34 
 
 
517 aa  86.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  38.79 
 
 
365 aa  86.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  35.56 
 
 
230 aa  85.9  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  38.6 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.59 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  38.39 
 
 
478 aa  84  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.66 
 
 
623 aa  84  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  35.25 
 
 
637 aa  82.4  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  30.45 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  38.39 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  23.2 
 
 
704 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  39.13 
 
 
239 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  38.05 
 
 
1793 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  31.31 
 
 
263 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1161  hypothetical protein  36.13 
 
 
344 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  39.13 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  30.53 
 
 
789 aa  79  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  34.13 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  41.07 
 
 
456 aa  77  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.53 
 
 
447 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  29.02 
 
 
648 aa  76.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.61 
 
 
422 aa  75.5  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  30.56 
 
 
1755 aa  75.1  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  32.59 
 
 
510 aa  74.7  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  36.04 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 
374 aa  74.3  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  34.92 
 
 
543 aa  74.3  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  27.24 
 
 
1313 aa  74.3  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  33.88 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  37.27 
 
 
218 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 
399 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  37.12 
 
 
215 aa  72.8  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.92 
 
 
542 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  28.38 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  32.88 
 
 
209 aa  73.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  32.88 
 
 
209 aa  73.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  36.59 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  35.96 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
217 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  33.33 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.05 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>