More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0595 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  100 
 
 
734 aa  1530    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  29.87 
 
 
757 aa  313  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  28.66 
 
 
798 aa  291  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  29.11 
 
 
666 aa  261  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  32.51 
 
 
813 aa  251  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  28.69 
 
 
653 aa  249  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  28.49 
 
 
712 aa  246  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  31.39 
 
 
626 aa  188  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  29.15 
 
 
665 aa  185  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  31.15 
 
 
645 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  28.6 
 
 
650 aa  182  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  28.25 
 
 
643 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  29.64 
 
 
660 aa  174  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  26.64 
 
 
642 aa  167  5.9999999999999996e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  28.24 
 
 
677 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  30.26 
 
 
613 aa  161  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  27.46 
 
 
585 aa  155  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  26.11 
 
 
778 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  31.44 
 
 
648 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  29.01 
 
 
656 aa  152  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  29.98 
 
 
668 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  26.77 
 
 
658 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  26.62 
 
 
630 aa  138  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  26.4 
 
 
471 aa  137  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  29.16 
 
 
594 aa  127  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  27.87 
 
 
631 aa  125  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  32.6 
 
 
671 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.19 
 
 
673 aa  123  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  29.87 
 
 
586 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  26.74 
 
 
672 aa  120  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  33.49 
 
 
568 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  25.49 
 
 
537 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  27.68 
 
 
710 aa  115  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  36.67 
 
 
640 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  26.61 
 
 
903 aa  112  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  24.87 
 
 
648 aa  111  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  42.5 
 
 
340 aa  110  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  25.54 
 
 
519 aa  110  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  41.27 
 
 
525 aa  104  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  22.44 
 
 
679 aa  104  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  38.89 
 
 
517 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  27.66 
 
 
631 aa  103  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  37.69 
 
 
641 aa  101  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  26.16 
 
 
620 aa  100  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  31.06 
 
 
630 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  34.53 
 
 
509 aa  99.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  40.32 
 
 
510 aa  98.6  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  38.89 
 
 
694 aa  97.8  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  41.53 
 
 
623 aa  97.4  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  37.23 
 
 
1313 aa  94.7  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  39.32 
 
 
239 aa  94.7  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  37.9 
 
 
669 aa  94.4  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 
637 aa  94  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  36.72 
 
 
656 aa  93.6  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 
412 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  38.02 
 
 
374 aa  92.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  27.36 
 
 
432 aa  92.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  29.9 
 
 
638 aa  92  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  35.48 
 
 
505 aa  91.3  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  36.8 
 
 
296 aa  90.9  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  27.4 
 
 
704 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  34.15 
 
 
422 aa  89  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 
364 aa  88.6  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  40.19 
 
 
478 aa  88.6  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  29.68 
 
 
427 aa  87  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 
241 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  31.61 
 
 
306 aa  85.9  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.14 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  34.38 
 
 
540 aa  84.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  36 
 
 
1987 aa  84.7  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 
388 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  26.85 
 
 
1793 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 
440 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 
459 aa  82  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 
1755 aa  81.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
543 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  28.24 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  36.36 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  36.36 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.94 
 
 
199 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  27.31 
 
 
263 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  38.32 
 
 
217 aa  80.5  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  40.45 
 
 
266 aa  80.1  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0591  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.27 
 
 
241 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  29.93 
 
 
670 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 
261 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  27.44 
 
 
263 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  41.05 
 
 
399 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  27.31 
 
 
263 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.67 
 
 
542 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.17 
 
 
188 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  34.92 
 
 
233 aa  79.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  38.32 
 
 
217 aa  79.7  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  41.67 
 
 
230 aa  79.7  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  34.51 
 
 
510 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.67 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.86 
 
 
170 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  37.84 
 
 
365 aa  78.6  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 
362 aa  78.6  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  37.17 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>