More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3476 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 645 aa  1320    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  40.98 
 
 		 630 aa  489  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  40.18 
 
 		 642 aa  472  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  37.14 
 
 		 665 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  38.05 
 
 		 650 aa  418  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  36.09 
 
 		 653 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  34.38 
 
 		 666 aa  401  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  35.76 
 
 		 643 aa  401  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  36.87 
 
 		 660 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  33.69 
 
 		 626 aa  345  2e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  35.63 
 
 		 712 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  31.59 
 
 		 677 aa  276  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 757 aa  263  6.999999999999999e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  31.84 
 
 		 613 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  30.73 
 
 		 648 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  31.75 
 
 		 668 aa  255  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.97 
 
 		 671 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  28.4 
 
 		 656 aa  201  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  25.72 
 
 		 672 aa  191  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  27.36 
 
 		 679 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  31.15 
 
 		 734 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  28.31 
 
 		 640 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  36.43 
 
 		 798 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  29.23 
 
 		 813 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  28.82 
 
 		 658 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  28.25 
 
 		 585 aa  171  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 		 631 aa  170  9e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  31.06 
 
 		 704 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  32.72 
 
 		 903 aa  163  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  27.54 
 
 		 673 aa  160  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  31.98 
 
 		 641 aa  160  9e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  26.96 
 
 		 620 aa  160  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  29.58 
 
 		 471 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  35.12 
 
 		 510 aa  148  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  31.88 
 
 		 694 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  29.38 
 
 		 630 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  26.58 
 
 		 712 aa  144  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  30.83 
 
 		 656 aa  143  8e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  29.69 
 
 		 778 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  32.4 
 
 		 669 aa  136  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  29.89 
 
 		 670 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  24.18 
 
 		 648 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  29.13 
 
 		 525 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  28.45 
 
 		 673 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  28.01 
 
 		 537 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  28.88 
 
 		 638 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  27.8 
 
 		 631 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  31.65 
 
 		 340 aa  118  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  28.65 
 
 		 519 aa  117  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  29.74 
 
 		 710 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  26.41 
 
 		 586 aa  113  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  28.65 
 
 		 517 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  24.22 
 
 		 594 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  26.03 
 
 		 509 aa  106  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08086  hypothetical protein  43.75 
 
 		 366 aa  98.2  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  32.09 
 
 		 432 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  32.13 
 
 		 427 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  42.24 
 
 		 412 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  37.39 
 
 		 365 aa  90.9  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 		 362 aa  90.5  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  38.39 
 
 		 193 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  36.61 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  33.71 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  35.94 
 
 		 637 aa  84.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  38.17 
 
 		 1755 aa  84.7  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  33.92 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0024  OmpA domain-containing protein  36.52 
 
 		 194 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000404844  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 440 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.26 
 
 		 170 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  33.71 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  30.28 
 
 		 227 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  32.16 
 
 		 789 aa  80.1  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6878  Outer membrane lipoprotein omp16 precursor (peptidoglycan-associated lipoprotein)  37.14 
 
 		 149 aa  79  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.401181  normal  0.0290754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 623 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  41.12 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010814  Glov_3469  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.68 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00389403  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0277  OmpA/MotB domain-containing protein  29.77 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000132403  hitchhiker  0.000103139 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0225  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.04 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000120265  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  43.88 
 
 		 427 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3583  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.91 
 
 		 200 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5311  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.14 
 
 		 170 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  36.84 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.63 
 
 		 190 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1314  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.14 
 
 		 165 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4843  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.14 
 
 		 170 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.678153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1815  OmpA/MotB  37.14 
 
 		 165 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.336374  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4748  OmpA/MotB  37.14 
 
 		 166 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5389  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.19 
 
 		 170 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  35.09 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  35.09 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  35.09 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2209  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.61 
 
 		 181 aa  74.7  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000116436  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  34.86 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  35.09 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1813  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.44 
 
 		 185 aa  74.7  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987869  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  37.38 
 
 		 321 aa  74.3  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  35.09 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  35.66 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>