More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0217 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  100 
 
 		 669 aa  1378    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  42.18 
 
 		 670 aa  499  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  37.39 
 
 		 704 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  39.11 
 
 		 673 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  44.03 
 
 		 694 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  41.34 
 
 		 537 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  41.42 
 
 		 525 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  40.52 
 
 		 517 aa  357  5e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  35.96 
 
 		 510 aa  303  6.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  35.99 
 
 		 640 aa  264  4e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  33.47 
 
 		 620 aa  256  7e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  33.67 
 
 		 641 aa  243  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  33.26 
 
 		 630 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  32.04 
 
 		 631 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 631 aa  234  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  30.67 
 
 		 658 aa  231  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.67 
 
 		 673 aa  224  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  30.41 
 
 		 638 aa  216  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  31.08 
 
 		 656 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  33.87 
 
 		 519 aa  183  8.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  31.63 
 
 		 509 aa  178  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  27.8 
 
 		 671 aa  178  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  30.57 
 
 		 648 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  32.79 
 
 		 679 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  29.98 
 
 		 668 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  28.52 
 
 		 672 aa  152  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  31.94 
 
 		 903 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  25.74 
 
 		 712 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  27.56 
 
 		 648 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  32.4 
 
 		 645 aa  136  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  31.38 
 
 		 710 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  25.48 
 
 		 643 aa  134  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  27.33 
 
 		 665 aa  132  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  28.66 
 
 		 660 aa  129  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  28.37 
 
 		 630 aa  127  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  28.38 
 
 		 677 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  34.35 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  29.08 
 
 		 650 aa  125  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  33.02 
 
 		 432 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  37.27 
 
 		 1313 aa  121  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  26.93 
 
 		 653 aa  120  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  34.63 
 
 		 412 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  24.51 
 
 		 656 aa  118  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  30.09 
 
 		 626 aa  115  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  26.61 
 
 		 642 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  28.09 
 
 		 666 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 263 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 263 aa  104  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 263 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 262 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  38.69 
 
 		 261 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.35 
 
 		 296 aa  101  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  44.92 
 
 		 543 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  28.35 
 
 		 585 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.07 
 
 		 542 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  44.92 
 
 		 544 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  49.52 
 
 		 219 aa  99.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  51.52 
 
 		 330 aa  98.2  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  43.97 
 
 		 242 aa  97.8  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  26.23 
 
 		 798 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  49.52 
 
 		 218 aa  97.4  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  49.52 
 
 		 218 aa  97.4  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 623 aa  97.4  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 264 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  42.99 
 
 		 294 aa  96.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  38.76 
 
 		 261 aa  95.9  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  41.8 
 
 		 424 aa  95.9  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  40.52 
 
 		 260 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  47.66 
 
 		 321 aa  94.7  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  42.61 
 
 		 352 aa  94.7  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  38.21 
 
 		 586 aa  94.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  37.9 
 
 		 734 aa  94.4  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  40.52 
 
 		 260 aa  94.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 637 aa  94.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.18 
 
 		 240 aa  94  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  38.58 
 
 		 594 aa  94  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  44.14 
 
 		 214 aa  94  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  44.35 
 
 		 218 aa  93.2  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 		 219 aa  92.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  26.72 
 
 		 613 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  44.14 
 
 		 210 aa  92.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  45.95 
 
 		 207 aa  92.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  42.31 
 
 		 478 aa  92.4  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  45.71 
 
 		 456 aa  92.4  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  31.46 
 
 		 505 aa  92.4  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  47.47 
 
 		 445 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  50 
 
 		 334 aa  91.7  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  46.67 
 
 		 212 aa  91.7  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  40.95 
 
 		 351 aa  91.3  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  40.91 
 
 		 231 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  40 
 
 		 350 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  40.71 
 
 		 314 aa  91.3  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  40 
 
 		 350 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  46.08 
 
 		 320 aa  91.3  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 		 189 aa  90.9  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  38.6 
 
 		 261 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.99 
 
 		 407 aa  90.9  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  38.6 
 
 		 261 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  39.66 
 
 		 243 aa  90.9  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  40.68 
 
 		 188 aa  89.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>