More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1316 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  91.94 
 
 		 187 aa  345  3e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  50.93 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  50.93 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  48.84 
 
 		 219 aa  205  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  49.75 
 
 		 214 aa  201  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  53.26 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  48.28 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  52.78 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  47.64 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  45.9 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  44.27 
 
 		 215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.27 
 
 		 215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  50.55 
 
 		 218 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  44.85 
 
 		 209 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  46.37 
 
 		 222 aa  161  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  46.37 
 
 		 222 aa  161  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  45.81 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  45.81 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.81 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  50.28 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  45.81 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  45.81 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  45.86 
 
 		 224 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  45.86 
 
 		 224 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  45.86 
 
 		 224 aa  157  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  45.86 
 
 		 224 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  45.86 
 
 		 224 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  45.3 
 
 		 224 aa  157  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  47.8 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  47.8 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  46.15 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  55.8 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  47.53 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  62.5 
 
 		 607 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  42.46 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  37.79 
 
 		 217 aa  131  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  56.64 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  42.61 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  38.89 
 
 		 225 aa  120  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 		 227 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  50 
 
 		 609 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  39.07 
 
 		 207 aa  107  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 240 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  49.02 
 
 		 230 aa  98.6  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  52.33 
 
 		 222 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  41.41 
 
 		 358 aa  98.6  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  40.62 
 
 		 346 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  40.62 
 
 		 354 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  40.62 
 
 		 346 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  40.62 
 
 		 346 aa  97.1  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  40.62 
 
 		 346 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  40.62 
 
 		 350 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  40.62 
 
 		 365 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  40.62 
 
 		 346 aa  97.1  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  47.66 
 
 		 331 aa  95.9  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  33.73 
 
 		 244 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 296 aa  95.5  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  39.52 
 
 		 387 aa  95.5  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 		 216 aa  94.7  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  40.71 
 
 		 216 aa  94.7  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  39.85 
 
 		 353 aa  94.4  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  39.84 
 
 		 371 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  39.85 
 
 		 353 aa  94.4  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  39.84 
 
 		 369 aa  94.7  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  39.85 
 
 		 357 aa  94.4  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  39.84 
 
 		 358 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  39.84 
 
 		 358 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 227 aa  93.2  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  33.73 
 
 		 237 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  39.06 
 
 		 369 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.82 
 
 		 230 aa  93.2  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  39.32 
 
 		 261 aa  92.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 		 231 aa  92.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  44.04 
 
 		 903 aa  92  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  37.82 
 
 		 212 aa  91.7  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  39.06 
 
 		 351 aa  91.7  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  30.99 
 
 		 239 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 247 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  42.99 
 
 		 220 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  42.99 
 
 		 220 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 224 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  42.99 
 
 		 220 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  48.11 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  42.06 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  38.76 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  42.99 
 
 		 220 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  40.68 
 
 		 669 aa  89.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  39.09 
 
 		 237 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  42.99 
 
 		 220 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 		 243 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 224 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  42.31 
 
 		 260 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  42.31 
 
 		 260 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 263 aa  89.4  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  37.18 
 
 		 294 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>