More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3744 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 679 aa  1400    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  46.4 
 
 		 671 aa  582  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  37.12 
 
 		 594 aa  291  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  30.72 
 
 		 586 aa  243  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  30.42 
 
 		 641 aa  234  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  30.35 
 
 		 903 aa  232  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  28.98 
 
 		 640 aa  228  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  27.63 
 
 		 656 aa  224  3e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  29.07 
 
 		 658 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  26.64 
 
 		 710 aa  213  7e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  27.37 
 
 		 631 aa  210  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  28.55 
 
 		 673 aa  206  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  28.01 
 
 		 668 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  28.84 
 
 		 648 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  26.71 
 
 		 638 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  27.36 
 
 		 645 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  27.91 
 
 		 626 aa  189  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  27.83 
 
 		 665 aa  188  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  28.3 
 
 		 672 aa  181  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  27.63 
 
 		 643 aa  181  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  27.15 
 
 		 677 aa  178  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  28.44 
 
 		 631 aa  177  4e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  26.59 
 
 		 630 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  27.24 
 
 		 620 aa  172  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  27.47 
 
 		 704 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  26.59 
 
 		 642 aa  170  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  29.66 
 
 		 630 aa  166  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  28.07 
 
 		 653 aa  166  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  32.79 
 
 		 669 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  30.04 
 
 		 650 aa  162  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  25.18 
 
 		 656 aa  160  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  27.81 
 
 		 666 aa  157  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  26.3 
 
 		 660 aa  155  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  30.34 
 
 		 670 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  28.16 
 
 		 694 aa  151  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  24.16 
 
 		 648 aa  150  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  28.88 
 
 		 510 aa  150  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  26.53 
 
 		 525 aa  145  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  28.19 
 
 		 757 aa  141  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  27.84 
 
 		 712 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  25.69 
 
 		 585 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  24.89 
 
 		 537 aa  137  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  28.75 
 
 		 517 aa  135  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  26.78 
 
 		 509 aa  131  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  25.14 
 
 		 613 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  26.74 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  29.1 
 
 		 673 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  27.33 
 
 		 798 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  45.59 
 
 		 365 aa  117  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  43.54 
 
 		 778 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  43.38 
 
 		 362 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  24.76 
 
 		 712 aa  112  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  31.22 
 
 		 568 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  43.7 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  22.44 
 
 		 734 aa  104  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  33.03 
 
 		 427 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  29.19 
 
 		 412 aa  100  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  41.74 
 
 		 296 aa  99.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  37.5 
 
 		 1313 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 		 193 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  39.34 
 
 		 322 aa  97.8  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  43.12 
 
 		 464 aa  95.5  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  28.71 
 
 		 813 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  29.77 
 
 		 432 aa  95.1  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  45.13 
 
 		 266 aa  94  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  41.18 
 
 		 375 aa  93.2  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 244 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 388 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  40.32 
 
 		 200 aa  92.8  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 375 aa  93.2  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40.34 
 
 		 240 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  39.66 
 
 		 422 aa  91.7  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  42.34 
 
 		 463 aa  91.3  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.87 
 
 		 407 aa  91.3  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  42.24 
 
 		 424 aa  91.7  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40.52 
 
 		 230 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  41.28 
 
 		 464 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.96 
 
 		 294 aa  90.1  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 		 230 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  38.62 
 
 		 176 aa  89.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  40.68 
 
 		 231 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 		 230 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  41.59 
 
 		 478 aa  87.8  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  39.29 
 
 		 239 aa  87.8  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.03 
 
 		 707 aa  87.4  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 306 aa  87.4  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  38.79 
 
 		 230 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  38.6 
 
 		 286 aa  87  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  39.66 
 
 		 211 aa  87  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  40.65 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  39.13 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  39.5 
 
 		 233 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  44.09 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  41.44 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 537 aa  84.7  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  41.07 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  40.87 
 
 		 346 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  40.87 
 
 		 354 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  40.87 
 
 		 346 aa  83.2  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>