More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3216 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
176 aa  353  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  50.33 
 
 
200 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
217 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4096  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 
180 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287994  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  39.87 
 
 
217 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1203  OmpA/MotB domain-containing protein  41.57 
 
 
193 aa  98.2  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.232705 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  39.71 
 
 
252 aa  97.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  38.3 
 
 
366 aa  95.5  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  46.96 
 
 
200 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2977  OmpA/MotB domain protein  45.61 
 
 
198 aa  93.6  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1463  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.373103  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  38.62 
 
 
679 aa  89  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 
322 aa  88.2  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  45.16 
 
 
362 aa  87  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  40.48 
 
 
534 aa  85.1  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  44.54 
 
 
560 aa  84.7  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  47.22 
 
 
294 aa  84.3  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  44.54 
 
 
219 aa  84.3  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  40.62 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  41.67 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.57 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.74 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  42.15 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  45.13 
 
 
607 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  40.88 
 
 
228 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  43.59 
 
 
219 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  44.64 
 
 
350 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  44.64 
 
 
350 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  34.93 
 
 
671 aa  81.3  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  45.54 
 
 
345 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  42.86 
 
 
365 aa  80.9  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  40.15 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  44.07 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  46.9 
 
 
327 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  43.75 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  40.15 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  43.59 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  44.74 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  44.07 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  45.37 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  43.59 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  37.82 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.18 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3118  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.82 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  43.59 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  43.75 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  42.98 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  42.48 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  32.54 
 
 
356 aa  79  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  42.98 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 
242 aa  79  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  43.75 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  43.75 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 
236 aa  79  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  44.07 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  42.98 
 
 
319 aa  78.2  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  41.46 
 
 
228 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  42.11 
 
 
240 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  42.37 
 
 
261 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  36.53 
 
 
355 aa  77  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  42.37 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  43.22 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  41.96 
 
 
344 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  40.65 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0727  OmpA/MotB domain protein  36.42 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36.57 
 
 
345 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
477 aa  75.1  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  38.66 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  43.59 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  42.28 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  40.68 
 
 
260 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  42.86 
 
 
344 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  40.35 
 
 
217 aa  74.3  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  35.54 
 
 
333 aa  74.3  0.0000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 
230 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  40.65 
 
 
230 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  39.84 
 
 
226 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  40.68 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  41.46 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  43.48 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  37.38 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.68 
 
 
521 aa  73.2  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  41.74 
 
 
609 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  41.6 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  39.68 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  39.13 
 
 
363 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>