More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7252 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  377  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  50.33 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 534 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  43.18 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  40.29 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  45.53 
 
 		 560 aa  87.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  41.27 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2977  OmpA/MotB domain protein  51.35 
 
 		 198 aa  85.5  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  50.46 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.8 
 
 		 521 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1463  OmpA/MotB domain protein  40.86 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  38.28 
 
 		 366 aa  82.4  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  46.28 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  40.5 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 679 aa  80.5  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  46.49 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  46.49 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  44.74 
 
 		 351 aa  78.6  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  45.22 
 
 		 327 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  40.65 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  33.14 
 
 		 252 aa  78.2  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 239 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  42.15 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  39.67 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  43.75 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  34.38 
 
 		 477 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  45.95 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  38.58 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  39.68 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  37.19 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  37.9 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  38.52 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  42.48 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  38.98 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  38.28 
 
 		 337 aa  74.7  0.0000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  36.29 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  46.09 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  38.02 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  51.95 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  40.77 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  41.59 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  45.45 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  45.45 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  36.29 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  42.4 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  37.3 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  38.6 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  41.6 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  40.32 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  36.51 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  36.8 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  46.09 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  36.29 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  42.4 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  38.58 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  43.9 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  37.98 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.48 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  34.38 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  37.1 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.14 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  36.72 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  38.4 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  42.48 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  36.96 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  34.92 
 
 		 236 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  34.92 
 
 		 240 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.74 
 
 		 220 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  37.1 
 
 		 217 aa  72  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  34.92 
 
 		 247 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  34.59 
 
 		 288 aa  72  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  37.29 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 229 aa  72  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  34.65 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  37.3 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 		 218 aa  71.2  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1751  OmpA family protein  38.79 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  37.29 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  40.94 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 		 471 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1566  OmpA family outer membrane protein  38.79 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>