More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_12471 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  517  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  48.48 
 
 		 217 aa  189  5e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  44.19 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  43.24 
 
 		 671 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  41.04 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  39.71 
 
 		 176 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  42.19 
 
 		 200 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  43.59 
 
 		 430 aa  97.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  46.43 
 
 		 375 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 362 aa  95.9  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  43.97 
 
 		 366 aa  95.5  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  42.37 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  32.81 
 
 		 537 aa  92.8  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  47.17 
 
 		 447 aa  92.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  40.28 
 
 		 403 aa  91.7  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  45.95 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  45.95 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  45.95 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  39.5 
 
 		 365 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 179 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  42.5 
 
 		 351 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.92 
 
 		 344 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  41.6 
 
 		 205 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  44.14 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  43.15 
 
 		 477 aa  89.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  45.05 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  45.95 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  38.74 
 
 		 594 aa  88.2  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  44.14 
 
 		 262 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  40.77 
 
 		 429 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  45.05 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  43.12 
 
 		 266 aa  87  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  38.89 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  45.95 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  43.52 
 
 		 264 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  41.96 
 
 		 420 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  36.17 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 322 aa  86.3  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.66 
 
 		 427 aa  86.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.52 
 
 		 407 aa  85.9  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  41.74 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  42.98 
 
 		 212 aa  85.5  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  36.72 
 
 		 555 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  39.47 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  37.01 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  36.81 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  31.58 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  36.22 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  41.44 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  36.81 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37.82 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  36.22 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  41.82 
 
 		 626 aa  84  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  39.2 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  37.21 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  35.48 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37.82 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  44.63 
 
 		 543 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0727  OmpA/MotB domain protein  41.74 
 
 		 178 aa  83.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 586 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  39.17 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  39.17 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  43.8 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  36.05 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  35.76 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.8 
 
 		 542 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  39.17 
 
 		 344 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  36.73 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  35.43 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  39.67 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  35.43 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  39.17 
 
 		 344 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  36.94 
 
 		 640 aa  82.4  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  36.81 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  36.94 
 
 		 466 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  31.69 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  36.89 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  33.56 
 
 		 560 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  43.64 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  39.84 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  32.62 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  43.86 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  35.43 
 
 		 1026 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.8 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  43.41 
 
 		 355 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  42.15 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  44.74 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  44.74 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.9 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>