More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1860 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
477 aa  947    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  35.44 
 
 
521 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 
534 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  35.68 
 
 
471 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  29.67 
 
 
560 aa  99  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  43.15 
 
 
252 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  39.39 
 
 
217 aa  87  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  32.05 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  28.84 
 
 
356 aa  82  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  39.71 
 
 
228 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  43.48 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  40.83 
 
 
278 aa  79.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 
264 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  38.24 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  38.64 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
239 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  43.52 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  37.7 
 
 
200 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  37.01 
 
 
403 aa  76.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  42.24 
 
 
219 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.8 
 
 
217 aa  75.9  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
239 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6051  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 
642 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  40.65 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 
219 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0626  OmpA/MotB domain protein  37.39 
 
 
366 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153451  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 
215 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  42.2 
 
 
231 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
210 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  40.91 
 
 
214 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  39.83 
 
 
226 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  35.56 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  39.34 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  39.34 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  39.34 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  39.34 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  39.34 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  39.34 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  39.34 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  39.34 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  41.82 
 
 
212 aa  71.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  31.14 
 
 
671 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1463  OmpA/MotB domain protein  38.52 
 
 
193 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.373103  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1230  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 
1124 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172002  decreased coverage  0.00819992 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  39.34 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  38.6 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7209  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 
652 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0110011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  38.52 
 
 
369 aa  70.1  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 
221 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 
221 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1469  outer membrane protein A  38.02 
 
 
351 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000845833  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  38.05 
 
 
420 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  41.67 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02680  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)protein  41.03 
 
 
430 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181066  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  40.52 
 
 
221 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  38.62 
 
 
276 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  39.52 
 
 
227 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 
208 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  35.65 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.35 
 
 
220 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  37.7 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  38.98 
 
 
220 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3148  OmpA/MotB domain-containing protein  40.16 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  37.7 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  37.7 
 
 
358 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  37.7 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  34.81 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 
228 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0995  OmpA/MotB domain protein  38.02 
 
 
179 aa  68.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.28 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  38.84 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2528  peptidoglycan-associated lipoprotein  42.37 
 
 
163 aa  67.8  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139934  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  40.74 
 
 
334 aa  68.2  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  36.84 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2549  outer membrane protein A  37.19 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000121755  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3892  OmpA/MotB domain protein  28.53 
 
 
365 aa  67.4  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309252  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0563  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  37.19 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1698  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000544254  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 
233 aa  67  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.74 
 
 
319 aa  67  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  32.84 
 
 
185 aa  67  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  37.8 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  34.23 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  37.8 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1832  OmpA/MotB  37.72 
 
 
523 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 
224 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 
248 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>