More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0181 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  53.66 
 
 		 209 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  57.41 
 
 		 225 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  46.96 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  51.21 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  50.89 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  42.17 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  48.85 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  44.51 
 
 		 230 aa  152  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  44.93 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  48.61 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  44.81 
 
 		 218 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  49.72 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  46.48 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  36.57 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  36.57 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  47.71 
 
 		 231 aa  138  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  48.84 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  40.93 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  43.27 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  40.87 
 
 		 215 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  42.69 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 231 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  40 
 
 		 241 aa  127  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  41.94 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  41.59 
 
 		 224 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  45.64 
 
 		 222 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  40.44 
 
 		 208 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  43.52 
 
 		 225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  48.33 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  39.49 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  39.35 
 
 		 224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  43.44 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  39.86 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  41.91 
 
 		 224 aa  109  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  43.09 
 
 		 239 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  35.48 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  46.63 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  42.22 
 
 		 219 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  42.04 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  44.96 
 
 		 230 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  41.13 
 
 		 175 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  34.84 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  34.84 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  34.84 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  34.84 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.31 
 
 		 351 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 222 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  47.2 
 
 		 210 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  50.44 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  36.92 
 
 		 224 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  41.04 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  48.67 
 
 		 344 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  40.44 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  38.07 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  40.44 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  45.76 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  41.18 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 		 205 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  32.71 
 
 		 217 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  47.79 
 
 		 344 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  38.97 
 
 		 221 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  36.88 
 
 		 230 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  47.79 
 
 		 344 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  36.88 
 
 		 230 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  47.79 
 
 		 344 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  39.71 
 
 		 224 aa  99  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  47.79 
 
 		 344 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  39.86 
 
 		 222 aa  99  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  46.9 
 
 		 219 aa  99  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 247 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  36.17 
 
 		 230 aa  99  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 236 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  37.16 
 
 		 217 aa  99  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 240 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  40.44 
 
 		 221 aa  98.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0716  OmpA/MotB domain-containing protein  38.97 
 
 		 226 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  46.9 
 
 		 345 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  38.97 
 
 		 221 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 182 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  39.55 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  36.76 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  35.1 
 
 		 219 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  46.36 
 
 		 219 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  36.99 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  46.34 
 
 		 350 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  46.34 
 
 		 350 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  40 
 
 		 237 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>