More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1423 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  61.7 
 
 		 239 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  63.27 
 
 		 240 aa  258  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  60 
 
 		 264 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  59.57 
 
 		 239 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  62.22 
 
 		 237 aa  244  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  41.18 
 
 		 210 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  41.18 
 
 		 210 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  43.93 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  49.42 
 
 		 294 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  43.51 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  43.93 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  43.93 
 
 		 230 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  43.1 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  43.88 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  45.91 
 
 		 333 aa  124  9e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  37 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 		 445 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  42.5 
 
 		 440 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  43.12 
 
 		 345 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 376 aa  115  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  42.01 
 
 		 447 aa  115  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  42.77 
 
 		 337 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  42.6 
 
 		 429 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  42.77 
 
 		 337 aa  112  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  42.07 
 
 		 351 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  43.12 
 
 		 350 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  50.98 
 
 		 219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  43.12 
 
 		 350 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.14 
 
 		 344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  43.44 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  49.02 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  50.98 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  49.02 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  38.14 
 
 		 344 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 445 aa  108  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 362 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  50.41 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.37 
 
 		 319 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  40.88 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  37.2 
 
 		 478 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  40.22 
 
 		 402 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  44.83 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  37.65 
 
 		 449 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  43.94 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  37.95 
 
 		 623 aa  106  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  39.31 
 
 		 428 aa  105  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  40.12 
 
 		 365 aa  105  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  49.22 
 
 		 344 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  48.31 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  39.02 
 
 		 375 aa  105  9e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  39.02 
 
 		 375 aa  105  9e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  40.49 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  45.97 
 
 		 415 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  53.4 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  43.33 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  51.79 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  53.19 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  36.87 
 
 		 420 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  48.04 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  47.06 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  50.96 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  51.49 
 
 		 407 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  39.02 
 
 		 344 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  33.7 
 
 		 320 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  39.02 
 
 		 344 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  39.02 
 
 		 345 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  50.96 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  39.02 
 
 		 344 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  44.6 
 
 		 352 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  39.13 
 
 		 348 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  47.57 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 1755 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  46.08 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  50.96 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  37.06 
 
 		 187 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  37.87 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  37.22 
 
 		 543 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  49.51 
 
 		 209 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  50 
 
 		 212 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.2 
 
 		 427 aa  99.8  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  44.63 
 
 		 342 aa  99.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  50.96 
 
 		 481 aa  99.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  48.54 
 
 		 215 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  48.54 
 
 		 215 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  48.54 
 
 		 215 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  48.54 
 
 		 215 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  41.67 
 
 		 355 aa  99.4  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  48.54 
 
 		 215 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  46.55 
 
 		 226 aa  99.4  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  48.54 
 
 		 215 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.01 
 
 		 607 aa  99  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  49.53 
 
 		 288 aa  99  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  48.28 
 
 		 296 aa  98.6  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 		 218 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  34.98 
 
 		 231 aa  98.6  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>