More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2054 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  100 
 
 		 223 aa  445  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  48.08 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  51.21 
 
 		 263 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  49.75 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  45.4 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  41.78 
 
 		 233 aa  149  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  42.99 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  46.59 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  45.74 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  48.68 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  37.61 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  44.75 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  43.45 
 
 		 228 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  41.61 
 
 		 244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  38.65 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 217 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  37.43 
 
 		 241 aa  128  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  46.36 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  40.45 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 231 aa  124  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  42.08 
 
 		 215 aa  124  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  47.03 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  39.44 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  46.89 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  43.09 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  41.77 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  39.44 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  43.75 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  41.99 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  43.06 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 222 aa  121  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  45.95 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  41.56 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  40.14 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  37.79 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  42.55 
 
 		 223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  42.25 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  39.6 
 
 		 205 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  42.03 
 
 		 208 aa  115  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  42.36 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  41.61 
 
 		 220 aa  111  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  39.44 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  41.84 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  34.72 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  40.28 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  34.72 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  41.61 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  41.61 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  44.65 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2341  OmpA/MotB domain protein  42.96 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  35.44 
 
 		 225 aa  106  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  33.48 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  43.86 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  43.59 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  43.59 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  37.84 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  41.46 
 
 		 215 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  35.94 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  35.94 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  35.94 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  35.94 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  35.94 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  41.94 
 
 		 367 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  35.4 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  39.15 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  34.72 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  35.98 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  34.72 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  34.72 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  41.61 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  34.72 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  34.72 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  34.72 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  37.91 
 
 		 224 aa  102  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  43.33 
 
 		 244 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.13 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  36.23 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  34.26 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40.46 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  35.02 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  41.01 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  41.13 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  39.86 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  41.21 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  44.76 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  39.91 
 
 		 221 aa  98.6  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  43.75 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  37.68 
 
 		 217 aa  98.6  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  41.32 
 
 		 237 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  39.86 
 
 		 236 aa  98.2  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 240 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 247 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>