More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2050 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  100 
 
 		 235 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  56.94 
 
 		 217 aa  226  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  60.7 
 
 		 244 aa  214  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  60.75 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  54.21 
 
 		 216 aa  211  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  54.21 
 
 		 216 aa  211  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  60 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  56.54 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  63.27 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  57.35 
 
 		 221 aa  205  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  57.62 
 
 		 219 aa  204  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  60.4 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  54.05 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  60.13 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  45 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  46.94 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  49.66 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  47.37 
 
 		 294 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  53.1 
 
 		 187 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  45.71 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  51.52 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  51.52 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  46.15 
 
 		 209 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  50.76 
 
 		 217 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  41.06 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  51.97 
 
 		 209 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  45.71 
 
 		 215 aa  135  8e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  51.97 
 
 		 209 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  50.38 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  50.38 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  50.38 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  50.38 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  50.38 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  50.38 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  50.38 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  50.38 
 
 		 316 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  51.56 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  47.79 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  47.79 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  51.56 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  48.44 
 
 		 214 aa  125  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  48.44 
 
 		 215 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  48.44 
 
 		 215 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  48.44 
 
 		 215 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  47.86 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  38.94 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 218 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  49.19 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  40 
 
 		 218 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  45.99 
 
 		 230 aa  118  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  40.28 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  40.28 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  40.48 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  34.53 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  39.29 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  44.97 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  40.29 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  42.03 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  46.85 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  37.14 
 
 		 205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  34.08 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  35.78 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  34.08 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  38.36 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  41.4 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  40.76 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  40.76 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  40.76 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  40.76 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  40.76 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  40.76 
 
 		 219 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  46.67 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  46.67 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  39.53 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  40.36 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  40.72 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 221 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  40.28 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  40.72 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  39.9 
 
 		 209 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  43.8 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  42.36 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  39.91 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  40.27 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  45.04 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  40.74 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  45.26 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  38.3 
 
 		 217 aa  105  5e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  36.82 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>