More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2190 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
217 aa  430  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  86.05 
 
 
217 aa  299  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  85.58 
 
 
217 aa  297  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  72.86 
 
 
215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  72.86 
 
 
215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  72.86 
 
 
215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  72.86 
 
 
215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  72.38 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  72.86 
 
 
215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  72.86 
 
 
215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  72.86 
 
 
316 aa  238  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  70.56 
 
 
214 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  70.56 
 
 
215 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  71.9 
 
 
214 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  70.56 
 
 
215 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  70.09 
 
 
232 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  70.56 
 
 
215 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  70.09 
 
 
215 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  67.37 
 
 
212 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  66.84 
 
 
294 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  64.59 
 
 
209 aa  207  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  64.59 
 
 
209 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  61.72 
 
 
209 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  44.76 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  48.13 
 
 
227 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  46.08 
 
 
216 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 
216 aa  145  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 
222 aa  144  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  44.94 
 
 
244 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  44.91 
 
 
220 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  46.95 
 
 
221 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  50.76 
 
 
235 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  45.57 
 
 
217 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  47.5 
 
 
219 aa  134  8e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  42.62 
 
 
241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  45.86 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  45.5 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  52.03 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  37.68 
 
 
215 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  47.83 
 
 
230 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  44.53 
 
 
229 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  44.75 
 
 
220 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  42.99 
 
 
219 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  42.99 
 
 
219 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 
231 aa  121  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  45.81 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  40.47 
 
 
225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  42.28 
 
 
248 aa  118  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  39.45 
 
 
228 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 
228 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  47.33 
 
 
221 aa  118  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  43.86 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  43.13 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  43.13 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  43.13 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  43.13 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  38.32 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  43.13 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  39.72 
 
 
243 aa  116  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  41.35 
 
 
214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  39.91 
 
 
220 aa  115  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  39.72 
 
 
221 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  47.33 
 
 
222 aa  115  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  42.35 
 
 
224 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  39.63 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  42.52 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  42.52 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  42.52 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  42.52 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  42.52 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  42.52 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  43.17 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  43.17 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  37.62 
 
 
225 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  47.33 
 
 
220 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  45.86 
 
 
221 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  45.86 
 
 
221 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  43.28 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  42.06 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  44.6 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  44.27 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  45.93 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  39.44 
 
 
217 aa  109  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  36.55 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  46.97 
 
 
237 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  46.97 
 
 
237 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  42.04 
 
 
223 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  46.21 
 
 
222 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  41.01 
 
 
236 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  41.27 
 
 
217 aa  105  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  45.8 
 
 
217 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  44.27 
 
 
221 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 
236 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  37.39 
 
 
225 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  41.57 
 
 
215 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  45.8 
 
 
219 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  45.8 
 
 
219 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  45.8 
 
 
219 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>