More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5155 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 187 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  55.56 
 
 		 219 aa  170  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  42.93 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  52.41 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  53.15 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  51.75 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  50.35 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  39.15 
 
 		 216 aa  154  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  39.15 
 
 		 216 aa  154  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  53.1 
 
 		 235 aa  154  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  49.66 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  49.31 
 
 		 217 aa  151  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  50.34 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  48.97 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  46.48 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  44.44 
 
 		 294 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  45.19 
 
 		 209 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.7 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  43.7 
 
 		 217 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  43.7 
 
 		 212 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  43.28 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  34.29 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  39.04 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  41.79 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  43.26 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  42.22 
 
 		 261 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  43.75 
 
 		 241 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 215 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  40.31 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 215 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 215 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  41.09 
 
 		 222 aa  101  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  44.7 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  44.96 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  44.96 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  40.74 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  44.96 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  40.74 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  40.74 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  45.04 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  44.96 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  44.96 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  40.74 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  40.74 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  40.74 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  40.74 
 
 		 316 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  40 
 
 		 214 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  39.26 
 
 		 214 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  41.09 
 
 		 218 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  42.42 
 
 		 219 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  42.42 
 
 		 219 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  42.42 
 
 		 219 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  42.42 
 
 		 219 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  42.42 
 
 		 219 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  42.42 
 
 		 219 aa  98.2  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  42.42 
 
 		 219 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  42.42 
 
 		 219 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  42.42 
 
 		 219 aa  98.2  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  39.85 
 
 		 222 aa  97.8  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  41.79 
 
 		 221 aa  97.1  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  42.42 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  39.53 
 
 		 222 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 241 aa  96.3  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  40 
 
 		 241 aa  96.3  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  41.54 
 
 		 248 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  30.84 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 232 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  38.81 
 
 		 224 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 224 aa  95.1  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  44.55 
 
 		 240 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  37.98 
 
 		 237 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  37.98 
 
 		 237 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  38.17 
 
 		 537 aa  94.4  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  41.67 
 
 		 220 aa  93.6  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  38.81 
 
 		 236 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  39.85 
 
 		 230 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  46.6 
 
 		 607 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  40.15 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0666  OmpA/MotB domain-containing protein  39.85 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000515803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3356  OmpA/MotB domain-containing protein  39.85 
 
 		 230 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000065492  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  39.1 
 
 		 228 aa  93.2  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  42.64 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  39.1 
 
 		 230 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  39.1 
 
 		 230 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  39.1 
 
 		 230 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  39.1 
 
 		 230 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  45.61 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  38.35 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  40.91 
 
 		 220 aa  92.8  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 		 364 aa  92  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  40.3 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  35.88 
 
 		 217 aa  92  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  40.3 
 
 		 221 aa  92  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.12 
 
 		 218 aa  92  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  40.15 
 
 		 224 aa  91.7  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>