More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1591 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  100 
 
 
227 aa  454  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  85.19 
 
 
220 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  63.01 
 
 
222 aa  259  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  66.67 
 
 
244 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  61.21 
 
 
216 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  61.21 
 
 
216 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  57.64 
 
 
217 aa  224  9e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  59.35 
 
 
221 aa  222  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  63.13 
 
 
219 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  58.85 
 
 
217 aa  218  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  60.55 
 
 
225 aa  216  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  58.59 
 
 
235 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  60.56 
 
 
214 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  53.37 
 
 
229 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  54.86 
 
 
227 aa  162  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  52.41 
 
 
187 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  46.67 
 
 
212 aa  148  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  45.26 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  47.92 
 
 
217 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  47.92 
 
 
217 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  48.95 
 
 
217 aa  141  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  40.89 
 
 
215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  41.58 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  40.45 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  47.55 
 
 
214 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  51.59 
 
 
209 aa  131  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  51.59 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  47.09 
 
 
209 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 
215 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 
215 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  46.15 
 
 
215 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  45.45 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  45.45 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  45.45 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  45.45 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  45.45 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  45.45 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  45.45 
 
 
215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 
215 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  45.45 
 
 
214 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  45.45 
 
 
316 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 
232 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  40.64 
 
 
218 aa  125  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  36.28 
 
 
225 aa  121  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  41.63 
 
 
220 aa  121  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  43.8 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  43.28 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  47.45 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  43.28 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  45.14 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  38.71 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  38.79 
 
 
219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  38.79 
 
 
219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  38.99 
 
 
218 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  43.03 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  43.07 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  40.2 
 
 
205 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  40.26 
 
 
248 aa  112  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
236 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 
220 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  37.85 
 
 
230 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  37.85 
 
 
230 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  37.85 
 
 
230 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 
220 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 
220 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 
220 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  38.46 
 
 
220 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  37.85 
 
 
230 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  38.92 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  39.34 
 
 
219 aa  108  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  39.34 
 
 
219 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  39.34 
 
 
219 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  39.34 
 
 
219 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  39.34 
 
 
219 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  39.34 
 
 
219 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  38.46 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  42.41 
 
 
228 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 
219 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  41.77 
 
 
228 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  34.53 
 
 
225 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  39.88 
 
 
223 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  41.09 
 
 
537 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  38.86 
 
 
219 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  41.3 
 
 
221 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  41.3 
 
 
221 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  41.27 
 
 
242 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 
219 aa  105  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 
218 aa  104  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  42.73 
 
 
218 aa  104  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.16 
 
 
218 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  45.11 
 
 
222 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  39.46 
 
 
224 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  35.03 
 
 
228 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  37.67 
 
 
222 aa  101  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  42.73 
 
 
214 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  40.58 
 
 
220 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  38.97 
 
 
223 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  41.26 
 
 
217 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>