More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0958 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 243 aa  475  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  57.55 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  57.55 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  56.07 
 
 		 210 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  55.97 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  55.1 
 
 		 219 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  59.44 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  59.59 
 
 		 219 aa  228  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  58.58 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  54.92 
 
 		 219 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  54.4 
 
 		 217 aa  205  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  49.55 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  49.55 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  46.46 
 
 		 218 aa  178  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  45.7 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  44.14 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 		 187 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0973  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.04 
 
 		 215 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0727581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3010  OmpA/MotB domain protein  39.04 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0354586  normal  0.0152683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  38.65 
 
 		 215 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2581  OmpA family protein  40.18 
 
 		 209 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0192  OmpA family protein  39.69 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0436  OmpA family protein  39.69 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398004  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2891  ompA family protein  39.69 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3002  outer membrane protein a precursor  39.69 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2953  ompA family protein  39.69 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1631  OmpA family protein  38.91 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  37.7 
 
 		 188 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  56.59 
 
 		 607 aa  148  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  38.28 
 
 		 222 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  38.28 
 
 		 222 aa  148  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0998  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4152  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.5 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1039  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0560  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370432  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  60.94 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1228  OmpA/MotB  60.94 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.37425e-26  normal  0.223193 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0955  OmpA family protein  40.76 
 
 		 179 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  41.63 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  48.55 
 
 		 609 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  46.15 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  43.04 
 
 		 363 aa  115  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2188  OmpA/MotB  33.95 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.166555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  36.73 
 
 		 227 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  44.55 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  46.36 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  48.04 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 388 aa  101  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  49.02 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  45 
 
 		 207 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  41.55 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  45.71 
 
 		 537 aa  99.4  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  36.52 
 
 		 345 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  44.04 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  45.1 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.55 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  49.07 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  42.96 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  41.27 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  45.22 
 
 		 217 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 220 aa  95.9  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  37 
 
 		 350 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  37 
 
 		 350 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  44.95 
 
 		 235 aa  95.5  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  46.51 
 
 		 344 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  44.14 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  46.51 
 
 		 344 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  44.14 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  46.51 
 
 		 344 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  42.2 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1882  OmpA/MotB  44.44 
 
 		 387 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0874277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 205 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  51.43 
 
 		 348 aa  93.2  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 		 220 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  43.24 
 
 		 220 aa  92.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0248  OmpA/MotB domain protein  49.5 
 
 		 367 aa  92  7e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  43.64 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  40 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 		 220 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  34.38 
 
 		 221 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  34.38 
 
 		 221 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  46.08 
 
 		 230 aa  92  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 224 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  34.38 
 
 		 221 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 218 aa  91.7  9e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  43.64 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  49.02 
 
 		 319 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  44.86 
 
 		 318 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  41.98 
 
 		 344 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  45.74 
 
 		 344 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36.36 
 
 		 345 aa  90.5  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.07 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 		 206 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 		 206 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  39.62 
 
 		 342 aa  90.1  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  43.22 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>