More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0248 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0248  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 367 aa  723    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0873  OmpA/MotB domain protein  57.7 
 
 		 314 aa  318  7.999999999999999e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1182  YadA domain protein  65.38 
 
 		 224 aa  270  2e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0888  YadA domain protein  39.75 
 
 		 210 aa  167  4e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1166  Outer membrane protein and related peptidoglycan- associated (lipo)protein-like protein  48.55 
 
 		 151 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0301  YadA domain protein  32.87 
 
 		 2075 aa  96.3  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0227  YadA domain protein  32.52 
 
 		 2092 aa  94.4  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0362  YadA domain protein  31.01 
 
 		 2073 aa  92.8  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0173  YadA domain protein  31.01 
 
 		 2078 aa  92.8  9e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0174  YadA domain protein  30.61 
 
 		 2091 aa  92  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0600  YadA domain protein  31.08 
 
 		 601 aa  91.7  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  49.5 
 
 		 243 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1408  YadA domain protein  31.01 
 
 		 2078 aa  80.9  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1243  YadA domain protein  32.81 
 
 		 1411 aa  80.5  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  44.55 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  38.24 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  46.53 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  45.54 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.44 
 
 		 609 aa  73.6  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  43.56 
 
 		 214 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  32.93 
 
 		 367 aa  72.8  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  37.62 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  43.56 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.55 
 
 		 607 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  43.56 
 
 		 187 aa  69.3  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.27 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  32.67 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  36.63 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  41.84 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.62 
 
 		 240 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  40.21 
 
 		 217 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  38.66 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  38.39 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  26.27 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  36.27 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  31.11 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  35.92 
 
 		 352 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.31 
 
 		 707 aa  62.8  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  30.15 
 
 		 537 aa  62.8  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  33.33 
 
 		 212 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  38.24 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 209 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1913  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467087  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  30.37 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  39.77 
 
 		 227 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  36.63 
 
 		 187 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  40.2 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  32.67 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  40.37 
 
 		 218 aa  62  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  36.63 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 587 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  40.37 
 
 		 217 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  35.29 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  37.86 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  25.6 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  37.62 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  35.14 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  36.63 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  35.92 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  27.03 
 
 		 648 aa  60.1  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0615  OmpA/MotB domain-containing protein  30.67 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  37.76 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  31.63 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  31.68 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  26.37 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  34.95 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  38.53 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  33.63 
 
 		 543 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>