More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0391 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  98.1 
 
 		 316 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  89.69 
 
 		 316 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  89.69 
 
 		 316 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  88.54 
 
 		 320 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  89.24 
 
 		 316 aa  510  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  95.55 
 
 		 247 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  80.21 
 
 		 311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  80.35 
 
 		 310 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  80.35 
 
 		 310 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  80.57 
 
 		 310 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  80.7 
 
 		 310 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  80.35 
 
 		 310 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  80.92 
 
 		 310 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  80.35 
 
 		 310 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  78.11 
 
 		 320 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  68.88 
 
 		 277 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  57.64 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  52 
 
 		 268 aa  252  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2625  OmpA/MotB  97.65 
 
 		 85 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0480  OmpA/MotB domain-containing protein  97.65 
 
 		 85 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  32.43 
 
 		 463 aa  125  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  32.11 
 
 		 463 aa  119  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  32.2 
 
 		 459 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  33.48 
 
 		 464 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  31.49 
 
 		 729 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  29.96 
 
 		 464 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  29.79 
 
 		 464 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  30.57 
 
 		 464 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  27.95 
 
 		 464 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  30.08 
 
 		 707 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 		 445 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  30.67 
 
 		 642 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  46.23 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 227 aa  95.5  9e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  45 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  45 
 
 		 237 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  30.25 
 
 		 652 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 498 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  30.25 
 
 		 652 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  42.28 
 
 		 220 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  44.76 
 
 		 456 aa  92.4  8e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 440 aa  92.4  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 537 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 231 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  31.73 
 
 		 658 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  42.57 
 
 		 220 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 		 227 aa  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  37.7 
 
 		 525 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 543 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 222 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  44.55 
 
 		 402 aa  90.1  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 441 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  40.17 
 
 		 206 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  37.38 
 
 		 424 aa  90.1  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  41.58 
 
 		 294 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 		 458 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  31.22 
 
 		 617 aa  89.4  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 510 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  34.97 
 
 		 236 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  34.97 
 
 		 240 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  41 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  42.86 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  34.97 
 
 		 240 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  40 
 
 		 451 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  38.18 
 
 		 533 aa  88.2  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  39.32 
 
 		 206 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 		 220 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  43.56 
 
 		 219 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.32 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 		 220 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 		 220 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 		 220 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 219 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 		 220 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  42.57 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  42.57 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  42.57 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.31 
 
 		 542 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  42.57 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  42.57 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  39.13 
 
 		 434 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  37.3 
 
 		 704 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  40.8 
 
 		 217 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  42.57 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  42.57 
 
 		 219 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 219 aa  87  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  42.57 
 
 		 219 aa  87  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  38.61 
 
 		 214 aa  86.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 544 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  38.39 
 
 		 510 aa  86.7  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  41.58 
 
 		 420 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 		 219 aa  86.3  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 		 219 aa  86.3  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 		 219 aa  86.3  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0280  OmpA family outer membrane protein  38.18 
 
 		 533 aa  86.3  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 490 aa  85.9  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  29.79 
 
 		 326 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  36.67 
 
 		 449 aa  85.9  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>