More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1913 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1913  OmpA/MotB  100 
 
 		 363 aa  674    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.467087  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2246  OmpA/MotB domain-containing protein  56.03 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14079  decreased coverage  0.00792288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  36.67 
 
 		 261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.6 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  34.6 
 
 		 316 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  34.6 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  34.18 
 
 		 247 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  34.18 
 
 		 316 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  31.4 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  33.47 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10918  outer membrane protein A ompA  34.68 
 
 		 326 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  33.33 
 
 		 277 aa  96.7  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 		 222 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  48.57 
 
 		 230 aa  90.1  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  32.07 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  32.07 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  32.07 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 229 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  32.07 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  32.07 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  32.07 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  32.07 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  43.64 
 
 		 221 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  41.51 
 
 		 241 aa  86.7  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  48.57 
 
 		 212 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  49.02 
 
 		 222 aa  86.7  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 241 aa  86.7  6e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  44.66 
 
 		 225 aa  86.3  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 		 216 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  31.65 
 
 		 311 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  45.71 
 
 		 226 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  46.6 
 
 		 216 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  44.76 
 
 		 241 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  43.69 
 
 		 235 aa  85.5  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  29.25 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 525 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  45.71 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  40.57 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 449 aa  83.6  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  47.66 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 537 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  40.74 
 
 		 218 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  42.02 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  45.71 
 
 		 209 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  36.79 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  37.69 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  45.63 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  47.06 
 
 		 213 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  43.81 
 
 		 231 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  36.81 
 
 		 223 aa  82  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.78 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  43.4 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  43.4 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  39.81 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  45.71 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  40.57 
 
 		 463 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  44.66 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  45.95 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.2 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  45.79 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  44.76 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  44.55 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 270 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 221 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  39.6 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  47.52 
 
 		 187 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  38.38 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  41.41 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  30.49 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  43.93 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  43.81 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  43.27 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 217 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  50 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  44.76 
 
 		 648 aa  78.6  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.05 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2554  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.900658 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  45 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  31.97 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2813  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  34.58 
 
 		 510 aa  77.8  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  40.57 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  42.72 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 543 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>