More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2705 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  667    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  27.38 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04892  hypothetical protein  29.18 
 
 		 321 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  27.96 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  32.07 
 
 		 333 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  30.54 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  25.9 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  27.21 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  29.43 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  29.14 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2542  outer membrane protein A  25.07 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  9.37616e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3199  outer membrane protein A  25.34 
 
 		 353 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000381188  hitchhiker  0.00427506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2630  outer membrane protein A  25.34 
 
 		 353 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000088038  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  27.44 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  27.13 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  30.89 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 221 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  39.29 
 
 		 221 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 221 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  25.72 
 
 		 331 aa  89.7  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  27.87 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2698  outer membrane protein A  25.14 
 
 		 354 aa  86.7  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000118487  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.45 
 
 		 220 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  36.51 
 
 		 240 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  43.2 
 
 		 669 aa  85.1  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  40.18 
 
 		 220 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  42 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_010498  EcSMS35_2163  outer membrane protein A  25.62 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195857  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00961  outer membrane protein A (3a;II*;G;d)  25.78 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000050212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1066  outer membrane protein A  25.78 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.14063e-21  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2686  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  25.78 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000993272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2359  outer membrane protein A  25.78 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044176  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00968  hypothetical protein  25.78 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000788885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1121  outer membrane protein A  25.63 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116879  normal  0.89417 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2639  outer membrane protein A  25.63 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000698773  unclonable  0.0000000277772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  41.44 
 
 		 220 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 220 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 187 aa  82  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1071  outer membrane protein A  25.34 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  38.53 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1145  outer membrane protein A  24.93 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00470585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1111  outer membrane protein A  24.93 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000109909  hitchhiker  0.00334653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1179  outer membrane protein A  24.93 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000188951  normal  0.637141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  39.45 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  34.11 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1209  outer membrane protein A  25.56 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000342607  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2858  outer membrane protein A  24.86 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000165079  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.64 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  37.76 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  39.29 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  40.98 
 
 		 230 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 		 188 aa  79  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 		 224 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  26.65 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1133  outer membrane protein A  24.79 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000533703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1035  hemagglutinin antigen  25.2 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000658717  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1028  outer membrane protein A  25.07 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  30.71 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  47.3 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.39 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  48.61 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0482  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000816193  hitchhiker  0.00000930185 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0306  OmpA family protein  36.89 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000558154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.18 
 
 		 607 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  37.61 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1754  outer membrane protein A  25.89 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000540093  decreased coverage  0.000000507763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0773  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 236 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1621  OmpA/MotB domain protein  46.48 
 
 		 217 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0812  OmpA/MotB domain-containing protein  37.14 
 
 		 240 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  37.38 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  29.32 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  40.4 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  42.72 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  35.56 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  35.56 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  34.21 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  31.88 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  39.39 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0665  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000180741  normal  0.0736379 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  41.41 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>