More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5762 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 420 aa  861    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2755  hypothetical protein  45.89 
 
 		 269 aa  227  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0882  hypothetical protein  42.86 
 
 		 264 aa  210  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3516  hypothetical protein  44.83 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0408  hypothetical protein  29.39 
 
 		 255 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.609848  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5405  hypothetical protein  29.36 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  38.06 
 
 		 216 aa  100  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  38.06 
 
 		 216 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  39.29 
 
 		 214 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3839  hypothetical protein  28.17 
 
 		 253 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  42.37 
 
 		 890 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  40.77 
 
 		 215 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  45.54 
 
 		 318 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  40.77 
 
 		 215 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  40.77 
 
 		 215 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4633  putative periplasmic protein  26.98 
 
 		 274 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.396261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 		 369 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  42.28 
 
 		 321 aa  98.2  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  46.08 
 
 		 215 aa  97.8  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1468  hypothetical protein  30.48 
 
 		 278 aa  97.8  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0844  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 		 244 aa  97.1  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.73971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  42.57 
 
 		 220 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  42.57 
 
 		 220 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  46.46 
 
 		 360 aa  97.1  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  42.57 
 
 		 220 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  42.57 
 
 		 220 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  42.57 
 
 		 220 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  45.54 
 
 		 320 aa  96.3  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  38.85 
 
 		 215 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 214 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  38.85 
 
 		 215 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  38.85 
 
 		 215 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  38.85 
 
 		 215 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  38.85 
 
 		 215 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  39.23 
 
 		 232 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  39.23 
 
 		 215 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  38.85 
 
 		 215 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 537 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  40 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  45.54 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  39.85 
 
 		 337 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  37.58 
 
 		 217 aa  95.1  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 219 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 		 219 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  40.59 
 
 		 261 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  45.1 
 
 		 319 aa  94.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  40 
 
 		 261 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 		 219 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 		 219 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 		 219 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 		 219 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  45.97 
 
 		 510 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 		 219 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  39.83 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  41.58 
 
 		 219 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  41.58 
 
 		 219 aa  94.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1454  hypothetical protein  30.66 
 
 		 275 aa  94.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324285  hitchhiker  0.000084919 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 216 aa  93.6  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  40.38 
 
 		 348 aa  93.6  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  41.75 
 
 		 220 aa  93.6  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  40.98 
 
 		 349 aa  93.2  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 219 aa  93.2  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 		 187 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 		 209 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 217 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  44.44 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 222 aa  92.8  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  39.1 
 
 		 337 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.58 
 
 		 217 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  44.55 
 
 		 277 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  36.81 
 
 		 225 aa  92  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5056  hypothetical protein  24.06 
 
 		 260 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  48.48 
 
 		 206 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2124  hypothetical protein  22.86 
 
 		 268 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  47 
 
 		 542 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  48.48 
 
 		 206 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2171  putative periplasmic protein  22.86 
 
 		 268 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.575303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  41.18 
 
 		 217 aa  90.9  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  45.87 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 		 209 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  44.44 
 
 		 481 aa  90.5  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 		 231 aa  90.5  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  42.57 
 
 		 209 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  42.16 
 
 		 235 aa  90.5  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 		 219 aa  90.5  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 320 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  41.9 
 
 		 193 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  44.95 
 
 		 440 aa  90.1  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  44.55 
 
 		 321 aa  90.1  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  39.6 
 
 		 220 aa  90.1  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  35.61 
 
 		 350 aa  89.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 221 aa  89.7  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  38.84 
 
 		 533 aa  89.7  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  43.56 
 
 		 310 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  43.56 
 
 		 310 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  46 
 
 		 543 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 219 aa  89.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>