More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2532 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  100 
 
 		 319 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  58.52 
 
 		 447 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  56.03 
 
 		 420 aa  241  9e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  52.16 
 
 		 294 aa  233  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  50.85 
 
 		 427 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  53.77 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  46.22 
 
 		 314 aa  195  8.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  50.73 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  34.46 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  49.75 
 
 		 428 aa  182  6e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  46.28 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  44.35 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  46.38 
 
 		 417 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  40.42 
 
 		 478 aa  159  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  42.92 
 
 		 456 aa  157  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 543 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 490 aa  155  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  38.08 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  38.08 
 
 		 386 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.09 
 
 		 542 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  40.15 
 
 		 727 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  38.96 
 
 		 1755 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.69 
 
 		 412 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  40 
 
 		 1987 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  45.5 
 
 		 544 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  37.64 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  51.05 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  43.89 
 
 		 458 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  52.52 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 623 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 487 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 637 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  45.4 
 
 		 380 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  49.66 
 
 		 375 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  49.66 
 
 		 375 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  45.95 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  36.54 
 
 		 381 aa  136  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  45.71 
 
 		 333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  47.02 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 510 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  46.9 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  45.03 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  44.9 
 
 		 350 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  44.9 
 
 		 350 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  45.58 
 
 		 344 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  46.15 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  46.15 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  42.03 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  45.07 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  46.15 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.7 
 
 		 440 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  44.76 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.88 
 
 		 506 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  37.64 
 
 		 449 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  43.54 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  42.86 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  40.94 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  40.69 
 
 		 1264 aa  116  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  43.45 
 
 		 388 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  40.35 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  41.67 
 
 		 351 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  48.82 
 
 		 209 aa  113  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  40.62 
 
 		 498 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  47.06 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.55 
 
 		 240 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 445 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  38.73 
 
 		 239 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  58.42 
 
 		 1707 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  39.43 
 
 		 366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  36.26 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  46.72 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  40.79 
 
 		 445 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  38.37 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  44.54 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 237 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  48.15 
 
 		 218 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  42.34 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  47.41 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  46.61 
 
 		 330 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  41.78 
 
 		 215 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  51.49 
 
 		 224 aa  105  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 218 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 368 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  45.45 
 
 		 222 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  36.84 
 
 		 348 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  38.64 
 
 		 223 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  46.36 
 
 		 415 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 230 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  42.74 
 
 		 328 aa  102  6e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  40.8 
 
 		 233 aa  102  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 		 671 aa  102  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  40 
 
 		 229 aa  102  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  44.86 
 
 		 352 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  34.5 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  37.41 
 
 		 212 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  56.38 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  43.7 
 
 		 224 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  47.12 
 
 		 509 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>