113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1657 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  100 
 
 		 290 aa  591  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  43.8 
 
 		 427 aa  201  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  42.11 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  36.99 
 
 		 417 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  37 
 
 		 429 aa  165  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.51 
 
 		 447 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  29.79 
 
 		 401 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  41.76 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  34.93 
 
 		 486 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  38.59 
 
 		 459 aa  104  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 457 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  54 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  56.38 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  37.91 
 
 		 454 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  37.35 
 
 		 1707 aa  99.8  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  52.58 
 
 		 428 aa  99.4  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  35.23 
 
 		 466 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  29.17 
 
 		 381 aa  97.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  33 
 
 		 380 aa  96.3  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  40.24 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  39.37 
 
 		 443 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 432 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  36.05 
 
 		 434 aa  92.8  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  50 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  27.97 
 
 		 388 aa  85.9  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  31.36 
 
 		 466 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  48.39 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  30.27 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  30.72 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0365  OmpA domain-containing protein  29.95 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0769021  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  28.19 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  33.67 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  47.31 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  25.12 
 
 		 335 aa  67  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  27.97 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  27.35 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.87 
 
 		 542 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  47.83 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 		 727 aa  63.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  29.94 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2655  agarase  40.82 
 
 		 1335 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0452542  normal  0.27666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  27.35 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  27.35 
 
 		 350 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  47.14 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  44.95 
 
 		 544 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  44.95 
 
 		 543 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  26.36 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  26.36 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  26.36 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  28.05 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  50.53 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  28.23 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  26.44 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  47.67 
 
 		 1987 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  25.66 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  25.52 
 
 		 351 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  39.81 
 
 		 792 aa  56.2  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1132  OmpA/MotB domain protein  29.7 
 
 		 450 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000365045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  30.34 
 
 		 487 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  30.99 
 
 		 394 aa  53.5  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  30.07 
 
 		 415 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  24.69 
 
 		 348 aa  52.4  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6987  OmpA/MotB domain protein  32.71 
 
 		 514 aa  52.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146113  hitchhiker  0.000256581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  26.34 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  52 
 
 		 457 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  25.33 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3905  Thrombospondin type 3 repeat protein  51.19 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  42.86 
 
 		 1918 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  31.17 
 
 		 392 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0597  hypothetical protein  41.54 
 
 		 237 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0696516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.45 
 
 		 412 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  48.24 
 
 		 386 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  25.97 
 
 		 490 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 1264 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  33.04 
 
 		 722 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  44.71 
 
 		 386 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0876  peptidase domain protein  37.37 
 
 		 843 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  45 
 
 		 510 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 1755 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  31.01 
 
 		 722 aa  46.6  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  57.58 
 
 		 239 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  28.47 
 
 		 403 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  57.58 
 
 		 264 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  30.37 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  30.37 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  65.62 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  30.15 
 
 		 373 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  24.21 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  35.19 
 
 		 6109 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  24.7 
 
 		 319 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  30.73 
 
 		 458 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3116  WD40 domain-containing protein  30.25 
 
 		 544 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  58.06 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  20.89 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  52.94 
 
 		 445 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  28.36 
 
 		 366 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0606  YD repeat-containing protein  33.68 
 
 		 3662 aa  43.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3039  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 		 735 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000574662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  21.8 
 
 		 362 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>