More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1393 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1574  protein of unknown function DUF1111  53.78 
 
 		 970 aa  672    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  100 
 
 		 1707 aa  3511    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  35.66 
 
 		 879 aa  352  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  35.09 
 
 		 1028 aa  332  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0978  hypothetical protein  38.24 
 
 		 475 aa  267  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4476  hypothetical protein  38.14 
 
 		 475 aa  265  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  35.35 
 
 		 1059 aa  261  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0910  hypothetical protein  38.18 
 
 		 475 aa  259  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02714  hypothetical protein  37.86 
 
 		 443 aa  260  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0949  hypothetical protein  38.18 
 
 		 475 aa  260  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56840  hypothetical protein  37.42 
 
 		 473 aa  260  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003124  predicted thiol oxidoreductase  37.05 
 
 		 460 aa  254  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2202  hypothetical protein  36.6 
 
 		 501 aa  253  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.719415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4940  hypothetical protein  37.25 
 
 		 473 aa  251  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4314  protein of unknown function DUF1111  36.3 
 
 		 512 aa  250  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0642  hypothetical protein  37.55 
 
 		 503 aa  249  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.798381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3025  hypothetical protein  36.01 
 
 		 502 aa  249  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4063  hypothetical protein  36.26 
 
 		 475 aa  249  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3528  hypothetical protein  36.3 
 
 		 517 aa  248  9e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4367  lipoprotein, putative  36.7 
 
 		 475 aa  247  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4489  hypothetical protein  37.03 
 
 		 475 aa  245  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1459  hypothetical protein  35.95 
 
 		 479 aa  244  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0639282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3296  hypothetical protein  38.14 
 
 		 470 aa  241  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1785  hypothetical protein  37.09 
 
 		 462 aa  241  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2969  hypothetical protein  36.98 
 
 		 456 aa  241  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.594784 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0667  thiol oxidoreductase  38.51 
 
 		 480 aa  241  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27219  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0564  protein of unknown function DUF1111  35.29 
 
 		 510 aa  240  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0884  hypothetical protein  35.17 
 
 		 461 aa  239  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.858351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3869  protein of unknown function DUF1111  37.64 
 
 		 471 aa  238  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.421634  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1924  hypothetical protein  34.96 
 
 		 492 aa  238  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2562  hypothetical protein  35.17 
 
 		 475 aa  238  9e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000435033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2722  protein of unknown function DUF1111  40.72 
 
 		 427 aa  238  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.103047  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0196  hypothetical protein  35.6 
 
 		 502 aa  235  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.943997  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0687  thiol oxidoreductase containing 2 cytochrome c heme-binding sites  35.48 
 
 		 491 aa  235  7.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37850  hypothetical protein  37.31 
 
 		 471 aa  234  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0692567  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2834  hypothetical protein  35.73 
 
 		 469 aa  234  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1545  thiol oxidoreductase with 2 cytochrome c heme-binding sites  35.25 
 
 		 502 aa  231  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4577  protein of unknown function DUF1111  35.87 
 
 		 512 aa  231  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0615808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2558  hypothetical protein  35.03 
 
 		 459 aa  229  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0187724  hitchhiker  0.000000017904 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0334  hypothetical protein  34.35 
 
 		 528 aa  229  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52140  thiol oxidoreductase  35.36 
 
 		 452 aa  225  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.394978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1526  hypothetical protein  34.17 
 
 		 503 aa  224  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1991  hypothetical protein  35.26 
 
 		 450 aa  221  7.999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1369  hypothetical protein  33.96 
 
 		 517 aa  216  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.646546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.51 
 
 		 819 aa  216  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1461  thiol oxidoreductase-like  36.73 
 
 		 418 aa  207  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0454641  normal  0.0102137 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2144  hypothetical protein  31.35 
 
 		 541 aa  206  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0801721 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0677  hypothetical protein  31.2 
 
 		 543 aa  202  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0593754 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0938  hypothetical protein  39.6 
 
 		 541 aa  201  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0972  hypothetical protein  39.27 
 
 		 541 aa  199  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.216526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0812  hypothetical protein  38.61 
 
 		 542 aa  197  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0695  putative lipoprotein  30.93 
 
 		 538 aa  196  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0723  hypothetical protein  38.8 
 
 		 548 aa  195  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0792  hypothetical protein  38.61 
 
 		 549 aa  194  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2085  hypothetical protein  33.33 
 
 		 560 aa  192  7e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.792023  normal  0.948616 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1803  hypothetical protein  33.57 
 
 		 562 aa  191  8e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3791  hypothetical protein  31.45 
 
 		 539 aa  191  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  40.23 
 
 		 569 aa  191  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0672  hypothetical protein  38.46 
 
 		 551 aa  186  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.230866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  31.88 
 
 		 1441 aa  186  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1997  protein of unknown function DUF1111  33.62 
 
 		 737 aa  186  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107987  normal  0.248873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3195  hypothetical protein  33.75 
 
 		 421 aa  177  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.889412 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2090  protein of unknown function DUF1111  30.12 
 
 		 794 aa  162  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  37.24 
 
 		 918 aa  149  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  35.56 
 
 		 1234 aa  139  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1167 aa  139  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  34.55 
 
 		 954 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  31.73 
 
 		 526 aa  137  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1933  protein of unknown function DUF1111  27.92 
 
 		 472 aa  136  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.242314  normal  0.0976167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  31.83 
 
 		 982 aa  133  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.33 
 
 		 252 aa  127  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  33.94 
 
 		 1262 aa  127  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  36.36 
 
 		 610 aa  126  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  30.81 
 
 		 1799 aa  125  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  40.8 
 
 		 500 aa  124  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  58.62 
 
 		 447 aa  124  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  36.52 
 
 		 673 aa  122  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  49.64 
 
 		 417 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  32.33 
 
 		 642 aa  118  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  45.26 
 
 		 550 aa  118  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  32.33 
 
 		 641 aa  118  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  33.46 
 
 		 863 aa  117  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  62.24 
 
 		 294 aa  115  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  40.62 
 
 		 1024 aa  115  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  57 
 
 		 429 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  57.43 
 
 		 428 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  29.32 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  41.77 
 
 		 801 aa  114  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  31.15 
 
 		 930 aa  113  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  31.96 
 
 		 883 aa  112  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.67 
 
 		 1321 aa  112  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  58.42 
 
 		 319 aa  111  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  56 
 
 		 420 aa  111  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  30.43 
 
 		 279 aa  110  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  54.7 
 
 		 401 aa  110  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  29.75 
 
 		 630 aa  109  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  29.19 
 
 		 1028 aa  108  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.06 
 
 		 627 aa  107  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  30.36 
 
 		 383 aa  107  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  30.27 
 
 		 1338 aa  107  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>