More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2454 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  100 
 
 		 402 aa  796    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.3 
 
 		 427 aa  206  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  39.84 
 
 		 420 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  49.77 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  46.58 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  30.52 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.35 
 
 		 447 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  45.65 
 
 		 319 aa  182  9.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 428 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  47.95 
 
 		 543 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  47.95 
 
 		 544 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  47.03 
 
 		 542 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  43.04 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  42.17 
 
 		 374 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  43.05 
 
 		 401 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  45.5 
 
 		 1987 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  32.05 
 
 		 490 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  40.74 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  36.56 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  36.6 
 
 		 320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  39.09 
 
 		 623 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  49.74 
 
 		 266 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  36.69 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  44.21 
 
 		 510 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  35.95 
 
 		 727 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  38.11 
 
 		 1755 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  44.39 
 
 		 506 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  33.55 
 
 		 381 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  45.08 
 
 		 498 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  39.72 
 
 		 637 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  35.81 
 
 		 456 aa  123  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.78 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  39.36 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  39.04 
 
 		 380 aa  121  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  40.62 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  31.33 
 
 		 388 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  43.12 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  40.48 
 
 		 1264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  37.1 
 
 		 445 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  39.04 
 
 		 237 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  32.38 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  43.48 
 
 		 244 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.57 
 
 		 240 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  42.77 
 
 		 362 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  39.57 
 
 		 239 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  51.82 
 
 		 364 aa  106  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  41.57 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  28.69 
 
 		 486 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  38.59 
 
 		 344 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  49.52 
 
 		 321 aa  103  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  38.59 
 
 		 350 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  38.59 
 
 		 350 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  43.33 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  35.88 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.04 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  37.5 
 
 		 344 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  49.5 
 
 		 212 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  35.14 
 
 		 333 aa  100  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  49.5 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  35.83 
 
 		 264 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  52 
 
 		 1707 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  44.76 
 
 		 537 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 		 222 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  36.41 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  35.33 
 
 		 351 aa  97.8  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  36.41 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  48.51 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  36.41 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  49.5 
 
 		 294 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  40.22 
 
 		 290 aa  97.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  46.6 
 
 		 415 aa  96.7  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  48.11 
 
 		 630 aa  96.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  49.04 
 
 		 334 aa  96.7  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  36.41 
 
 		 345 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 525 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  44.23 
 
 		 218 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  42.86 
 
 		 352 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  42.52 
 
 		 206 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0175  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.22 
 
 		 584 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  42.52 
 
 		 206 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  50.5 
 
 		 209 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  39.76 
 
 		 241 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 239 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  49.5 
 
 		 209 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 1026 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  46.53 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  47.06 
 
 		 240 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  38.89 
 
 		 348 aa  94.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  48.51 
 
 		 209 aa  94.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0798  OmpA/MotB domain-containing protein  46.08 
 
 		 247 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870311  normal  0.182881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  45.1 
 
 		 237 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  46.73 
 
 		 286 aa  94  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  45.1 
 
 		 237 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  46.53 
 
 		 310 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>