More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0913 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  100 
 
 
337 aa  683    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  83.14 
 
 
337 aa  542  1e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  56.52 
 
 
345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  53.24 
 
 
333 aa  347  2e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  51.38 
 
 
335 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  39.58 
 
 
319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  39.58 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  41.3 
 
 
328 aa  243  5e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  39.29 
 
 
319 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  40.13 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  49.52 
 
 
350 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  49.52 
 
 
350 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  38.57 
 
 
344 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  38.57 
 
 
344 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  38.57 
 
 
344 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  39.36 
 
 
344 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.36 
 
 
344 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  37.54 
 
 
348 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  39.16 
 
 
344 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  45.71 
 
 
351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  40.23 
 
 
403 aa  149  8e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  54.17 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  40.15 
 
 
392 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  52.52 
 
 
319 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  50.34 
 
 
447 aa  143  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  28.64 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  51.39 
 
 
429 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 
365 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  27.45 
 
 
427 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 
388 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  50.7 
 
 
375 aa  135  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  40.18 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  47.4 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  45.62 
 
 
420 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  50 
 
 
380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 
369 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.9 
 
 
373 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 
369 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  38.5 
 
 
370 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  48.92 
 
 
294 aa  123  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  30.68 
 
 
366 aa  122  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
372 aa  122  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  44.29 
 
 
375 aa  119  7e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  36.07 
 
 
367 aa  119  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  44.29 
 
 
375 aa  119  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  35.83 
 
 
362 aa  119  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  30.15 
 
 
381 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  56.19 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  37.85 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 
369 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  33.2 
 
 
365 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  36.2 
 
 
368 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  34.27 
 
 
367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  40.62 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  31.44 
 
 
468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  28.78 
 
 
459 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  26.67 
 
 
466 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  42.07 
 
 
209 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  39.87 
 
 
237 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  36.73 
 
 
377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
239 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  33.99 
 
 
352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  39.75 
 
 
240 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  42.77 
 
 
244 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  35.21 
 
 
367 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 
428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  49.52 
 
 
223 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  52.38 
 
 
327 aa  109  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  30.2 
 
 
466 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40.13 
 
 
230 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  39.38 
 
 
239 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.13 
 
 
230 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  47.73 
 
 
352 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  41.56 
 
 
230 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 
440 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  28.45 
 
 
459 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  41.26 
 
 
201 aa  106  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  42 
 
 
478 aa  105  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  46.36 
 
 
321 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  40.65 
 
 
231 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  32.88 
 
 
373 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 
445 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  29.51 
 
 
454 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 
510 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 
230 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  42.96 
 
 
314 aa  102  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  35.48 
 
 
204 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  44.92 
 
 
228 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  46.61 
 
 
228 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  42.86 
 
 
229 aa  101  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  46.61 
 
 
228 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  41.01 
 
 
229 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  28.01 
 
 
457 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4399  OmpA/MotB domain-containing protein  32.05 
 
 
333 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.421249  normal  0.955819 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  47.12 
 
 
224 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  45.19 
 
 
218 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  41.48 
 
 
331 aa  99.8  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  48.72 
 
 
210 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>