More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2905 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 466 aa  973    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  91.67 
 
 		 468 aa  894    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  57.26 
 
 		 454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  56.09 
 
 		 459 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  54.97 
 
 		 459 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  52.24 
 
 		 457 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  50.42 
 
 		 466 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  35.21 
 
 		 447 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  30.45 
 
 		 427 aa  183  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  33.62 
 
 		 359 aa  166  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  45.02 
 
 		 432 aa  159  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  31.87 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  45.31 
 
 		 434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  31.96 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  31.58 
 
 		 319 aa  150  6e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  57.39 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  31.43 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  29.58 
 
 		 351 aa  146  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  30.09 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  31.82 
 
 		 344 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  31.82 
 
 		 344 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  31.82 
 
 		 344 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  31.14 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  31.14 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  30.39 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  29.17 
 
 		 381 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  30.42 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  30.42 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  33.8 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  29.16 
 
 		 345 aa  130  6e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  30.2 
 
 		 392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  29.94 
 
 		 327 aa  123  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  29.48 
 
 		 394 aa  123  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  51.38 
 
 		 210 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  32.83 
 
 		 403 aa  117  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  45.22 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  50.46 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  43.06 
 
 		 314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  27.52 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  49.07 
 
 		 333 aa  114  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  29.03 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  30.29 
 
 		 337 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  29.45 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  30.07 
 
 		 1793 aa  106  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  28.09 
 
 		 368 aa  106  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  26.99 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  28.15 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  46.36 
 
 		 209 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  42.61 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  47.66 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  44.83 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1132  OmpA/MotB domain protein  23.44 
 
 		 450 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000365045  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  46.79 
 
 		 223 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  27.02 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  26.01 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  41.59 
 
 		 209 aa  99  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  32.09 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  46.3 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  42.02 
 
 		 229 aa  98.2  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  45.19 
 
 		 416 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  26.23 
 
 		 365 aa  97.8  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  26.86 
 
 		 330 aa  97.8  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 		 209 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 		 200 aa  97.8  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  42.98 
 
 		 352 aa  97.1  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  41.38 
 
 		 218 aa  97.1  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 372 aa  97.1  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  41.59 
 
 		 209 aa  97.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  45.54 
 
 		 201 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  28.71 
 
 		 367 aa  96.3  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.45 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  28.62 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  47.52 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 349 aa  95.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  45.19 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  26.57 
 
 		 333 aa  95.5  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  48.04 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  44.12 
 
 		 201 aa  95.5  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  43.88 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  49.02 
 
 		 694 aa  95.5  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  41.38 
 
 		 212 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  40.37 
 
 		 420 aa  94.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  27.3 
 
 		 367 aa  94.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  28 
 
 		 369 aa  94.4  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  46 
 
 		 202 aa  94.4  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  45 
 
 		 169 aa  94  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 		 201 aa  94  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 229 aa  94  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 		 202 aa  93.6  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  44.64 
 
 		 202 aa  93.6  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 296 aa  93.2  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  27.67 
 
 		 363 aa  93.6  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 366 aa  93.2  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 		 337 aa  93.2  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  38.71 
 
 		 1984 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  47.06 
 
 		 219 aa  93.2  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 337 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  44.23 
 
 		 201 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>