More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0689 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 443 aa  897    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  42.41 
 
 		 432 aa  276  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  42.34 
 
 		 434 aa  269  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  37.27 
 
 		 417 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  36.85 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.82 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  33.64 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  48.26 
 
 		 333 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  31.59 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  47.74 
 
 		 333 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  46.82 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  42.77 
 
 		 459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  28.54 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1132  OmpA/MotB domain protein  27.27 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000365045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  41.52 
 
 		 457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  41.57 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  29.9 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  57.8 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  48.72 
 
 		 210 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  53.64 
 
 		 314 aa  118  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  50.46 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  28.3 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  49.14 
 
 		 350 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  49.14 
 
 		 350 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  52.34 
 
 		 375 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  44.26 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  47.27 
 
 		 327 aa  107  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  44.83 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  44.83 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  24.61 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  43.97 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  44.83 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  50.47 
 
 		 376 aa  104  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  34.76 
 
 		 290 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  28.46 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  44.83 
 
 		 344 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  27.25 
 
 		 345 aa  100  6e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  43.1 
 
 		 344 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  43.97 
 
 		 344 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  48.15 
 
 		 209 aa  97.8  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  43.4 
 
 		 380 aa  95.5  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  31.95 
 
 		 525 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  45.87 
 
 		 707 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  43.59 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  44.74 
 
 		 537 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 		 360 aa  90.5  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  45.71 
 
 		 623 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 		 236 aa  89  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  40.52 
 
 		 294 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  42.57 
 
 		 215 aa  88.6  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  43.8 
 
 		 543 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  45.74 
 
 		 1984 aa  88.2  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  46.23 
 
 		 348 aa  87  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 		 638 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  29.86 
 
 		 640 aa  87.4  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  45.63 
 
 		 417 aa  87  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 209 aa  87  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  38.89 
 
 		 209 aa  87  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  42.2 
 
 		 352 aa  86.3  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  40.52 
 
 		 212 aa  86.3  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 209 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.98 
 
 		 542 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  31.17 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  44.44 
 
 		 694 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 		 544 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  41.73 
 
 		 658 aa  84.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  41.28 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  24.34 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  38.94 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  41.12 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  38.21 
 
 		 2000 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  41.82 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  42.16 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 		 374 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  45.79 
 
 		 322 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  41.82 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 		 221 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  41.53 
 
 		 631 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  44.34 
 
 		 498 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  47.52 
 
 		 630 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  35.44 
 
 		 268 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  41.55 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  42.45 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  41.28 
 
 		 478 aa  82  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  41.58 
 
 		 502 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  43.93 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  30.43 
 
 		 641 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  41.44 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>