More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0122 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 310 aa  615  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  43.53 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  42.6 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  43.64 
 
 		 310 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 352 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  38.69 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  32.58 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  32.54 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 		 317 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  29.39 
 
 		 332 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 		 326 aa  102  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  29.08 
 
 		 331 aa  99.4  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  31.65 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  34.33 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  30.69 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  29.82 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  43.22 
 
 		 337 aa  93.2  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  30.34 
 
 		 487 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  40.31 
 
 		 364 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  43.86 
 
 		 349 aa  90.5  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  42.02 
 
 		 525 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  41.13 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  30.34 
 
 		 487 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  30.34 
 
 		 487 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  28.77 
 
 		 484 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  37.72 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  44.95 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  39.64 
 
 		 537 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 189 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  39.42 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  42.45 
 
 		 1313 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  40.78 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  45.98 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3029  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 		 555 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  36.59 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  41.38 
 
 		 543 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  36.11 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  38.69 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  37.1 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  38.41 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 432 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 638 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 372 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  43.52 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  45.65 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  43.52 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  31.13 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 		 485 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  31.93 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  43.52 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  42.53 
 
 		 466 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  43.68 
 
 		 459 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  31.89 
 
 		 670 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  41.82 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  39.5 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  44.34 
 
 		 630 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  34.21 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  42.06 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  42.53 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  35.24 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  40.52 
 
 		 544 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.52 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  35.14 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  42.2 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 		 485 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  34.21 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  42.73 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39.6 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  35.14 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  36.09 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  36.09 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  36.09 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  36.09 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  35.14 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  36.09 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  35.14 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  49.44 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  41.9 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>