More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0697 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  100 
 
 		 484 aa  1001    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  50.66 
 
 		 497 aa  502  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  50.22 
 
 		 481 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  48.55 
 
 		 485 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  48.76 
 
 		 485 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  48.34 
 
 		 485 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  48.76 
 
 		 485 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  48.34 
 
 		 485 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  47.37 
 
 		 481 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  48.46 
 
 		 479 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  45.15 
 
 		 487 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  45.36 
 
 		 487 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  44.65 
 
 		 487 aa  425  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  45.55 
 
 		 481 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  35.64 
 
 		 321 aa  176  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  37.5 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  34.73 
 
 		 332 aa  170  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  35.91 
 
 		 304 aa  151  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  35.62 
 
 		 317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  33.96 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 		 337 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  31.23 
 
 		 350 aa  144  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  32.9 
 
 		 331 aa  143  9e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  33.21 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  33.22 
 
 		 334 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  30.91 
 
 		 337 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  32.98 
 
 		 364 aa  123  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  28.71 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  31.28 
 
 		 310 aa  93.6  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  46.23 
 
 		 217 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  33.19 
 
 		 316 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 319 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  45.28 
 
 		 217 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  45.28 
 
 		 215 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  45.28 
 
 		 215 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 		 217 aa  90.9  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  45.28 
 
 		 215 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  45.28 
 
 		 215 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  45.28 
 
 		 215 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  45.28 
 
 		 215 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  45.28 
 
 		 261 aa  90.5  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  47.66 
 
 		 321 aa  90.5  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  43.81 
 
 		 294 aa  89.7  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  44.76 
 
 		 212 aa  89.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  45.28 
 
 		 316 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  30.04 
 
 		 310 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  31 
 
 		 315 aa  89  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 263 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  42.16 
 
 		 457 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  28.77 
 
 		 310 aa  88.2  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  44.12 
 
 		 320 aa  87.4  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  44.66 
 
 		 209 aa  86.7  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  39.22 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  42.15 
 
 		 623 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  42.45 
 
 		 214 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  45.63 
 
 		 209 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  42.48 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  44.66 
 
 		 209 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  39.67 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  34.91 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  35.84 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  42.16 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  39.67 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  41.59 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  39.67 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.88 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  42.31 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  41.51 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  39.67 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2804  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  45.45 
 
 		 327 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  37.8 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  38.17 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  38.17 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.67 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  35.76 
 
 		 184 aa  81.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  42.74 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  38.71 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  38.71 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  43.14 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  40.78 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  39.2 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  41.9 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  40.95 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  39.45 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  38.89 
 
 		 181 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>