More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0150 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  96.51 
 
 		 487 aa  971    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 487 aa  1006    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  96.3 
 
 		 487 aa  966    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  45.83 
 
 		 497 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  46.93 
 
 		 481 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  44.65 
 
 		 484 aa  425  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 		 485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  45.49 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  44.06 
 
 		 479 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  44.49 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  45.03 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  44.61 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  42.03 
 
 		 481 aa  363  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  36 
 
 		 321 aa  177  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  35.95 
 
 		 332 aa  170  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  37.59 
 
 		 317 aa  161  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  33.66 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  34.75 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 304 aa  143  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  30.89 
 
 		 350 aa  140  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  29.36 
 
 		 337 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  33.21 
 
 		 364 aa  126  8.000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  29.18 
 
 		 334 aa  123  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  29.41 
 
 		 337 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  28.53 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  30.65 
 
 		 326 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  28.77 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  43.52 
 
 		 263 aa  94.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  32.37 
 
 		 310 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.82 
 
 		 163 aa  90.9  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 316 aa  90.9  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  34.93 
 
 		 184 aa  89.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.19 
 
 		 319 aa  88.2  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  30.34 
 
 		 310 aa  88.2  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 623 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  32.37 
 
 		 310 aa  87  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  42.45 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 217 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  39.25 
 
 		 327 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6571  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.09 
 
 		 167 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 208 aa  86.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2693  peptidoglycan-associated lipoprotein  41.07 
 
 		 172 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.671246  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  37.93 
 
 		 248 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 		 261 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  40 
 
 		 163 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  40 
 
 		 163 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 		 244 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1943  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.12 
 
 		 196 aa  85.9  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.53224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  41.41 
 
 		 210 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  40 
 
 		 163 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 163 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  39.25 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  42.06 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.93 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.88 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  41.9 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  39.25 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  37.88 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  37.88 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  39.25 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  41.51 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  41.51 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  41.51 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  41.51 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  41.51 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  41.51 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  39.25 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2456  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.16 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  41.51 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  45.28 
 
 		 166 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  39.25 
 
 		 345 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0693  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.94 
 
 		 169 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.017916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  37.3 
 
 		 459 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36630  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  45.28 
 
 		 179 aa  82.8  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.668034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  35.17 
 
 		 260 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0676  OmpA/MotB domain-containing protein  35.94 
 
 		 169 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  41.51 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  41.51 
 
 		 261 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.28 
 
 		 166 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2588  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.94 
 
 		 176 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0799  OmpA-like protein  35.16 
 
 		 170 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00766515  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0768  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.16 
 
 		 170 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0396571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3971  peptidoglycan-associated lipoprotein  45.28 
 
 		 166 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1416  OmpA/MotB  45.28 
 
 		 167 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0389621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  38.58 
 
 		 537 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  42.16 
 
 		 240 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4401  OmpA/MotB  45.28 
 
 		 165 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0950269  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  31.25 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.37 
 
 		 217 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0316  OmpA/MotB  35.16 
 
 		 170 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00135962  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 217 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  39.09 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.32 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3888  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.16 
 
 		 170 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.34 
 
 		 166 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3992  peptidoglycan-associated lipoprotein  44.34 
 
 		 165 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>