More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0281 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  100 
 
 
315 aa  631  1e-180  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  41.69 
 
 
310 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 
316 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 
310 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  38.69 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  33.23 
 
 
352 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  31.8 
 
 
332 aa  113  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  28.38 
 
 
334 aa  90.5  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  31 
 
 
484 aa  89  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  27.44 
 
 
364 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 
210 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  27.24 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 
487 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 
487 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  37.19 
 
 
487 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  29.96 
 
 
481 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  36.45 
 
 
631 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  39.5 
 
 
485 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 
333 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  39.67 
 
 
485 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 
485 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  30.49 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  38.32 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  42.06 
 
 
260 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  26.82 
 
 
333 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 
337 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1344  OmpA/MotB domain-containing protein  34.06 
 
 
190 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124071  hitchhiker  0.0000223206 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  28.39 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  41.28 
 
 
398 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  39.5 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  28.76 
 
 
479 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  38.84 
 
 
481 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  41.18 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 
525 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  33.02 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  41.18 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  41.18 
 
 
344 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 
537 aa  76.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  38.02 
 
 
481 aa  77  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  34.55 
 
 
510 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  36.13 
 
 
433 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  39.25 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 
459 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.19 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  32.79 
 
 
640 aa  76.6  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  41.28 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  41.9 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  23.68 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 
417 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  39.47 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 
485 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  27.68 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 
189 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  29.08 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  40.19 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  28.57 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  39.22 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  34.71 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  40 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  36.52 
 
 
710 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  31.73 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  39.22 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 
510 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  38.74 
 
 
543 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  39.22 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  34.82 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  37.74 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  38.74 
 
 
544 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 
468 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  39.22 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  44.32 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  39.22 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  36.54 
 
 
429 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  40 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  28.97 
 
 
454 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  35.42 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  40.59 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  39.22 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 
658 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  34.85 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  38.24 
 
 
351 aa  72.4  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.84 
 
 
542 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  34.55 
 
 
669 aa  72.4  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>