More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1244 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  390  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1344  OmpA/MotB domain-containing protein  51.06 
 
 		 190 aa  201  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124071  hitchhiker  0.0000223206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3027  OmpA/MotB domain-containing protein  48.82 
 
 		 196 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3012  OmpA/MotB domain-containing protein  48.82 
 
 		 196 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000126863  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3170  OmpA/MotB domain-containing protein  48.82 
 
 		 196 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000129051  hitchhiker  0.0000476695 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1351  OmpA/MotB domain protein  48.82 
 
 		 196 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000530028  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  43.68 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  43.59 
 
 		 191 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000845715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  46.2 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1139  OmpA/MotB domain-containing protein  40.31 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528624  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 		 191 aa  151  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  43.08 
 
 		 191 aa  151  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000882937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 234 aa  134  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260064  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1358  OmpA/MotB  34.01 
 
 		 209 aa  121  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000545475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2804  OmpA/MotB domain-containing protein  32.7 
 
 		 215 aa  111  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  39.16 
 
 		 344 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.21 
 
 		 447 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  38.55 
 
 		 344 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  38.55 
 
 		 344 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  38.55 
 
 		 344 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  36.14 
 
 		 350 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  36.14 
 
 		 350 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2466  OmpA family protein  37.5 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.352028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  38.55 
 
 		 344 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  37.95 
 
 		 344 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  39.88 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  37.06 
 
 		 420 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  39.02 
 
 		 449 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  38.65 
 
 		 445 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  36.75 
 
 		 345 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  38.04 
 
 		 440 aa  101  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  35.98 
 
 		 351 aa  101  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  38.04 
 
 		 429 aa  98.2  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  36.65 
 
 		 375 aa  97.8  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  35.09 
 
 		 381 aa  95.9  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  36.48 
 
 		 209 aa  95.5  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  35.85 
 
 		 337 aa  95.5  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  35.85 
 
 		 337 aa  94.7  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  33.52 
 
 		 401 aa  95.1  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 376 aa  93.6  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  36.42 
 
 		 445 aa  90.9  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  34.59 
 
 		 333 aa  90.9  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  36.75 
 
 		 388 aa  89.4  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.05 
 
 		 319 aa  89  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  32.54 
 
 		 427 aa  89  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  35.37 
 
 		 372 aa  89  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  35.37 
 
 		 372 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  34.76 
 
 		 369 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  38.79 
 
 		 345 aa  86.7  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  34.76 
 
 		 369 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  31.76 
 
 		 417 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  34.15 
 
 		 373 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  34.34 
 
 		 369 aa  85.5  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  34.15 
 
 		 370 aa  85.1  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  33.73 
 
 		 363 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  34.32 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  33.75 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  34.15 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 335 aa  82.4  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  31.28 
 
 		 380 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  37.82 
 
 		 466 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  33.78 
 
 		 348 aa  82  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  30.86 
 
 		 367 aa  81.3  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  33.14 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  43.27 
 
 		 310 aa  81.6  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  34.97 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  36.13 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  31.03 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  31.29 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  36.97 
 
 		 459 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  32.32 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  32.1 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  41.18 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  38.36 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  36.13 
 
 		 459 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  42.06 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  33.14 
 
 		 544 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  31.49 
 
 		 320 aa  78.6  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  34.57 
 
 		 456 aa  78.6  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  28.35 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  28.35 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  35.98 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  31.29 
 
 		 375 aa  77.8  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  32.32 
 
 		 394 aa  77.8  0.00000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  34.86 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  34.34 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  29.63 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  31.29 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  36.25 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1220  OmpA/MotB domain protein  37.41 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  28.04 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  36.25 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  32.52 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>