More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2585 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
310 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  99.03 
 
 
310 aa  597  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  69.31 
 
 
316 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  42.39 
 
 
315 aa  222  8e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  42.76 
 
 
310 aa  207  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2464  OmpA/MotB  38.05 
 
 
352 aa  192  7e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  32.66 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  30.93 
 
 
321 aa  113  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  32.82 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  28.82 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  29.02 
 
 
349 aa  106  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  29.12 
 
 
350 aa  106  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  29.11 
 
 
337 aa  105  9e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  27.8 
 
 
331 aa  99.8  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  29.73 
 
 
497 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  30.58 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  28.91 
 
 
364 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  33.2 
 
 
487 aa  96.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  32.78 
 
 
487 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  31.28 
 
 
484 aa  94  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  45.71 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  45.71 
 
 
263 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  32.78 
 
 
487 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  31.8 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  43.81 
 
 
222 aa  90.1  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  37.5 
 
 
320 aa  90.1  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  31.01 
 
 
364 aa  90.1  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 
263 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 
479 aa  89.4  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  30.3 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  37.82 
 
 
348 aa  87  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  41.03 
 
 
433 aa  85.5  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  28.77 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  28.22 
 
 
481 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  38.53 
 
 
631 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  43.81 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  39.13 
 
 
481 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  39.17 
 
 
525 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 
485 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  38.35 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  38.35 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  38.35 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  46.6 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  44.76 
 
 
218 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  38.35 
 
 
214 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  36.5 
 
 
481 aa  79  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  32.96 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  38.84 
 
 
537 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  37.82 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  41.51 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  42.86 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 
375 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  35.85 
 
 
560 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 
560 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  35.17 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
214 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  39.05 
 
 
264 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  45.54 
 
 
458 aa  77  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 
296 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3385  OmpA/MotB  43.69 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.464249  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  35.65 
 
 
670 aa  75.9  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  41 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  33.73 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  33.73 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 
219 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 
219 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 
219 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
217 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  32.67 
 
 
468 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 
219 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 
189 aa  75.5  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 
219 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03353  hypothetical protein  41.51 
 
 
219 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 
219 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 
219 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 
219 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 
459 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  36.84 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  41.9 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  36.84 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5262  OmpA/MotB  41.35 
 
 
575 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  36.84 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  36.84 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  40 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  38.1 
 
 
215 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 
485 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  36.84 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  36.84 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>