More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1781 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
658 aa  1350    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  44.57 
 
 
638 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  39.34 
 
 
631 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  38.1 
 
 
656 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
631 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  37.34 
 
 
630 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  31.74 
 
 
641 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  30.87 
 
 
640 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  29.67 
 
 
620 aa  280  5e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  29.77 
 
 
673 aa  270  7e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  33.81 
 
 
670 aa  256  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  32.53 
 
 
694 aa  248  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  30.26 
 
 
704 aa  243  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  34.35 
 
 
509 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  30.69 
 
 
525 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  30.38 
 
 
671 aa  234  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  30.67 
 
 
669 aa  231  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  28.93 
 
 
712 aa  228  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  29.17 
 
 
648 aa  220  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  29.07 
 
 
679 aa  217  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  29.05 
 
 
903 aa  216  8e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  28.97 
 
 
668 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  30.11 
 
 
519 aa  213  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  28.75 
 
 
648 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  32.72 
 
 
510 aa  210  5e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  29.27 
 
 
537 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  27.74 
 
 
626 aa  206  8e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  29.05 
 
 
673 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  30.18 
 
 
653 aa  187  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  25.41 
 
 
710 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  27.54 
 
 
517 aa  183  9.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  27.5 
 
 
656 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  26.26 
 
 
650 aa  179  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  26.78 
 
 
672 aa  177  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  25.37 
 
 
665 aa  174  3.9999999999999995e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  27.7 
 
 
643 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  28.82 
 
 
645 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  22.81 
 
 
666 aa  164  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  30.37 
 
 
594 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  31.96 
 
 
677 aa  153  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  26.77 
 
 
642 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  29.57 
 
 
630 aa  145  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  26.85 
 
 
660 aa  144  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  26.77 
 
 
734 aa  143  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  36.32 
 
 
432 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  27.93 
 
 
798 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  29.36 
 
 
586 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  32.48 
 
 
757 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  27.2 
 
 
813 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 
427 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  36.23 
 
 
412 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  23.72 
 
 
504 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  30.68 
 
 
712 aa  113  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  30.43 
 
 
1313 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  38.34 
 
 
263 aa  108  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  37.91 
 
 
778 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  34.05 
 
 
585 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  43.04 
 
 
464 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  35.39 
 
 
293 aa  104  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  26.58 
 
 
613 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  40.74 
 
 
239 aa  101  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  34.47 
 
 
471 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  50.5 
 
 
463 aa  98.2  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  40.74 
 
 
424 aa  97.1  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  31.25 
 
 
505 aa  96.3  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  43.93 
 
 
398 aa  95.1  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  40.98 
 
 
729 aa  94  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 
241 aa  93.6  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  31.72 
 
 
316 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  45.71 
 
 
464 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  39.67 
 
 
361 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 
306 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  46.53 
 
 
434 aa  91.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  26.72 
 
 
300 aa  90.9  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 
459 aa  90.5  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 
1755 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  40.59 
 
 
209 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  42.28 
 
 
459 aa  89.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  43.56 
 
 
464 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  39.81 
 
 
380 aa  89.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  35.29 
 
 
320 aa  89  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 
417 aa  88.2  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  45.45 
 
 
466 aa  88.2  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  42.45 
 
 
890 aa  88.2  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  38.21 
 
 
543 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 
416 aa  88.2  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  38.21 
 
 
544 aa  87.4  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  43.43 
 
 
454 aa  87  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  41.82 
 
 
277 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3582  OmpA/MotB domain protein  36.44 
 
 
366 aa  87  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.645571  normal  0.625301 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.4 
 
 
542 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  43.56 
 
 
464 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  43.56 
 
 
464 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  38.18 
 
 
193 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  43.14 
 
 
333 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.95 
 
 
707 aa  85.9  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  42 
 
 
319 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  40 
 
 
233 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>