More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2092 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  100 
 
 		 327 aa  664    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  65.06 
 
 		 351 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  64.59 
 
 		 350 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  64.59 
 
 		 350 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  66.38 
 
 		 344 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  65.8 
 
 		 344 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  64.31 
 
 		 344 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  64.02 
 
 		 344 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  64.02 
 
 		 344 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  62.89 
 
 		 344 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  63.22 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  85.59 
 
 		 210 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  33.91 
 
 		 468 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 454 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  30.92 
 
 		 466 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  35.42 
 
 		 457 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  31.69 
 
 		 466 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 		 459 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  32.24 
 
 		 459 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  28.72 
 
 		 381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  45.59 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  33.98 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  52.54 
 
 		 447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  51.69 
 
 		 429 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  28.53 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  30.89 
 
 		 403 aa  126  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  32.53 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  31.27 
 
 		 394 aa  122  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  53.45 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  45.45 
 
 		 209 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  32.03 
 
 		 319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  30.65 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  33.44 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  32.62 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  31.56 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  55.24 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  44.35 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  50.41 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  31.91 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  45.69 
 
 		 427 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  45.87 
 
 		 333 aa  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  44.27 
 
 		 240 aa  112  9e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  32.3 
 
 		 345 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  54.29 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  52.38 
 
 		 261 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  54.29 
 
 		 263 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  54.29 
 
 		 263 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  47.22 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  46.27 
 
 		 337 aa  108  9.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  45.93 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  53.92 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  53.33 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  50.86 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  35.83 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  47.27 
 
 		 443 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1240  OmpA/MotB domain protein  42.34 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000641372  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  35.42 
 
 		 352 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 432 aa  106  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  53.33 
 
 		 262 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  53.33 
 
 		 263 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  51.49 
 
 		 224 aa  105  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  47.41 
 
 		 233 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  42.52 
 
 		 478 aa  103  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  46.55 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  47.41 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 		 417 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  49.53 
 
 		 218 aa  103  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  32.69 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  42.54 
 
 		 352 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  46.55 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  44.36 
 
 		 240 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  50.48 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  50.48 
 
 		 261 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1275  OmpA/MotB domain protein  51.89 
 
 		 227 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0265448  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  48.65 
 
 		 221 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  44.07 
 
 		 694 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  47.62 
 
 		 261 aa  99.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  26.26 
 
 		 366 aa  99.4  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  47.41 
 
 		 229 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  45.9 
 
 		 263 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  38.85 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  53.33 
 
 		 229 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  49.04 
 
 		 216 aa  97.8  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0439  OmpA/MotB domain protein  48.62 
 
 		 225 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 228 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  46.83 
 
 		 242 aa  98.2  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  49.04 
 
 		 189 aa  97.4  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  43.92 
 
 		 244 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  46.08 
 
 		 236 aa  97.1  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  46.49 
 
 		 215 aa  96.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  52.22 
 
 		 229 aa  97.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  43.52 
 
 		 367 aa  96.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  42.74 
 
 		 236 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  44.95 
 
 		 368 aa  96.7  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  40.57 
 
 		 211 aa  96.7  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  44.44 
 
 		 420 aa  95.9  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  49.04 
 
 		 228 aa  95.9  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  31.95 
 
 		 362 aa  95.9  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 		 288 aa  95.9  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>