More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0547 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  851    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  48.93 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  45.1 
 
 		 447 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  42.62 
 
 		 429 aa  316  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  40.47 
 
 		 417 aa  309  8e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  56.03 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  36.47 
 
 		 401 aa  231  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  50.5 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  54 
 
 		 294 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1657  opacity protein/surface antigen  42.11 
 
 		 290 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.92077e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  39.84 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  44.21 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  34.33 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  40.3 
 
 		 322 aa  171  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  31.73 
 
 		 459 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  32.1 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  37.07 
 
 		 478 aa  160  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  52.82 
 
 		 375 aa  157  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  29.07 
 
 		 454 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  44.51 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  51.77 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  43.66 
 
 		 543 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  49.1 
 
 		 335 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  34.13 
 
 		 487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  39.84 
 
 		 1987 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  40.15 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  38.96 
 
 		 1755 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  42.58 
 
 		 374 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  43.66 
 
 		 544 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 727 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.72 
 
 		 542 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  35.16 
 
 		 486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  27.99 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  34.84 
 
 		 637 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  47.18 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  47.18 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  49.65 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  47.18 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  46.48 
 
 		 344 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  45.81 
 
 		 345 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  46.05 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  48 
 
 		 333 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  48.23 
 
 		 337 aa  130  6e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  46.36 
 
 		 345 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  44.52 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  41.8 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  33.24 
 
 		 490 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 386 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  47.06 
 
 		 240 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  35.04 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  28.1 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  43.66 
 
 		 350 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  36.24 
 
 		 510 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  43.66 
 
 		 350 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  43.29 
 
 		 403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.67 
 
 		 412 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  42.77 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  29.71 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  37.36 
 
 		 457 aa  119  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  26.43 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  34.57 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 1264 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  35.51 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  40.3 
 
 		 266 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  39.52 
 
 		 445 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  41.62 
 
 		 239 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  37.42 
 
 		 369 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  37.42 
 
 		 369 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  34.35 
 
 		 623 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  41.21 
 
 		 466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  42.46 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  56 
 
 		 1707 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  40.97 
 
 		 367 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  42.35 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  42.96 
 
 		 209 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  39.88 
 
 		 264 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  37.09 
 
 		 372 aa  106  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  35.95 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  36.42 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.42 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  35.48 
 
 		 365 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  35.95 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  36.99 
 
 		 440 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 		 239 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  35.76 
 
 		 370 aa  103  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  37.58 
 
 		 377 aa  102  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1244  OmpA/MotB domain-containing protein  37.06 
 
 		 189 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327925  normal  0.573303 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  36.87 
 
 		 244 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  35.41 
 
 		 498 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 196 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  44.44 
 
 		 210 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  35.06 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3037  OmpA/MotB domain protein  35.91 
 
 		 432 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  41.61 
 
 		 362 aa  101  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  39.73 
 
 		 443 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  37.28 
 
 		 449 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  36.69 
 
 		 445 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  51.49 
 
 		 242 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  49.5 
 
 		 219 aa  99.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  35.62 
 
 		 328 aa  99  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>