More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1689 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  100 
 
 		 352 aa  720    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  51.86 
 
 		 344 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  50.72 
 
 		 345 aa  333  3e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  43.75 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  36.39 
 
 		 375 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  35.56 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  36.87 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  51.15 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  47.73 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  47.73 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  48.21 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  48.11 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  48.65 
 
 		 185 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  48.09 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  44.86 
 
 		 319 aa  102  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  39.13 
 
 		 217 aa  101  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  47.58 
 
 		 244 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  48.31 
 
 		 224 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  48.51 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 		 210 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  44.04 
 
 		 217 aa  100  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  49.07 
 
 		 231 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  45.19 
 
 		 226 aa  99.8  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  48.25 
 
 		 210 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  48.25 
 
 		 210 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000407187 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  40.83 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  42.75 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  42.75 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  42.4 
 
 		 375 aa  97.1  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 		 239 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  42.4 
 
 		 375 aa  96.7  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 		 296 aa  96.7  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  45.19 
 
 		 222 aa  96.3  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  44.04 
 
 		 230 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  42.34 
 
 		 222 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  44.04 
 
 		 230 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0293  OmpA/MotB domain protein  49.02 
 
 		 213 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0608822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  49.04 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  41.18 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  42.61 
 
 		 669 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  44.04 
 
 		 230 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  45.37 
 
 		 429 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  44.04 
 
 		 286 aa  94.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  41.22 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 224 aa  94.4  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  49.55 
 
 		 401 aa  94  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  45 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  44.12 
 
 		 215 aa  93.6  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  40.44 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 218 aa  93.6  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  43.59 
 
 		 351 aa  93.6  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  41.22 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  50 
 
 		 209 aa  92.8  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  41.22 
 
 		 344 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  41.22 
 
 		 344 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.98 
 
 		 344 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  39.69 
 
 		 362 aa  92.8  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  39.71 
 
 		 319 aa  92.8  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  46.23 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  42.15 
 
 		 242 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  38.69 
 
 		 220 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  43.12 
 
 		 623 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 		 440 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  41.98 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2282  OmpA/MotB domain protein  45.63 
 
 		 221 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  46.36 
 
 		 219 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  44.55 
 
 		 327 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  37.8 
 
 		 222 aa  90.9  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  44.44 
 
 		 447 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 		 537 aa  90.9  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  40.46 
 
 		 345 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  45.19 
 
 		 509 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  41.44 
 
 		 1026 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  37.23 
 
 		 228 aa  90.5  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  44.55 
 
 		 223 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 230 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  37.23 
 
 		 228 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  38.03 
 
 		 331 aa  90.5  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  44.23 
 
 		 205 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0120  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 218 aa  90.5  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 		 264 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1602  outer membrane protein OprF  34.58 
 
 		 240 aa  90.1  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  43.97 
 
 		 355 aa  90.1  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 261 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  44.23 
 
 		 294 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  44.34 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  38.53 
 
 		 260 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  38.17 
 
 		 365 aa  89.7  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  31.05 
 
 		 729 aa  89.7  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  45.37 
 
 		 420 aa  89.7  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 445 aa  89.7  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  47.47 
 
 		 219 aa  89.7  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  32.49 
 
 		 215 aa  89.7  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  40.32 
 
 		 314 aa  89.7  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  38.52 
 
 		 263 aa  89.4  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 236 aa  89.4  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1730  OmpA/MotB domain protein  37.59 
 
 		 322 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.262216  normal  0.802647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  46.15 
 
 		 212 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  36.57 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  41.51 
 
 		 478 aa  88.6  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>