More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2560 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
355 aa  697    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
560 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  31.3 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  43.97 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  46.15 
 
 
239 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 
471 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  39.84 
 
 
209 aa  87  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  46.22 
 
 
333 aa  86.7  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  48.65 
 
 
264 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  32.05 
 
 
477 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36.88 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  35.48 
 
 
229 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1848  NAD-dependent DNA ligase  41.18 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.449373  normal  0.815473 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  36.51 
 
 
233 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  37.78 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  38.52 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  38.52 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  45.05 
 
 
221 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  43.41 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  45.05 
 
 
221 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  40.34 
 
 
337 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40.17 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  46.23 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  45.05 
 
 
221 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  47.75 
 
 
239 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  47.62 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  38.21 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  35.25 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  44 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 
481 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.75 
 
 
447 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.55 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  52.05 
 
 
463 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  37.9 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  44 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  44.25 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  44 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  39.29 
 
 
237 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  36.23 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  37.29 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3406  OmpA/MotB domain-containing protein  39.82 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.64 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  35.59 
 
 
229 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  45.45 
 
 
481 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 
481 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  36.79 
 
 
367 aa  78.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  42.06 
 
 
485 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  44.44 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  28.08 
 
 
534 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  39.34 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  42.31 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  36.84 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  43.56 
 
 
294 aa  77.4  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3892  OmpA/MotB domain protein  35.84 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309252  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  44.14 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  44.14 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  44.14 
 
 
220 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  35.97 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4703  OmpA/MotB  32.61 
 
 
237 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0558247 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 
229 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 
485 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  42.31 
 
 
260 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 
176 aa  77  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  43 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  28.21 
 
 
521 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  44.86 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  43.86 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.9 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  39.68 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  44.14 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  36.21 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  35.07 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  38.18 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  39.82 
 
 
420 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  38.14 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 
228 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  38.14 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
224 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  41.88 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  38.46 
 
 
226 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  40.54 
 
 
219 aa  75.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 
487 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 
487 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  38.52 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  33.86 
 
 
237 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  33.86 
 
 
237 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1386  OmpA/MotB domain protein  37.88 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.848199  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 
485 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4416  OmpA/MotB domain-containing protein  35.59 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.632487  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2239  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  36.89 
 
 
217 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0241987  normal  0.443331 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  40.34 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  38.66 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 
485 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  40.19 
 
 
485 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  41.75 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 
218 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>