More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3406 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3406  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 291 aa  590  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.786122  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1172  OmpA/MotB domain-containing protein  69.47 
 
 		 295 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2725  OmpA/MotB  64.39 
 
 		 294 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1725  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.33 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.972471  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  45.79 
 
 		 207 aa  86.7  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  40.95 
 
 		 463 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 241 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  41.51 
 
 		 241 aa  82  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  43.4 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  41.58 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  40.37 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  42.86 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  42.86 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  42.86 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  42.86 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  42.86 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  42.86 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  42.86 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  41.12 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  38.68 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  40 
 
 		 466 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  41.96 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  42.86 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  42.86 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  43.4 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  42.31 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  41.18 
 
 		 707 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  37.38 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4226  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171921  normal  0.240797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0992  OmpA/MotB domain-containing protein  34.51 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  39.62 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  39.39 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  41.96 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  29.47 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  38.89 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 537 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  33.96 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  36.67 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4687  hypothetical protein  38.6 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3118  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.85 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53500  hypothetical protein  38.6 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118983 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  36.76 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  36.67 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0587  OmpA family outer membrane protein  40.74 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  28.95 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  37.38 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 459 aa  72.4  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  42.31 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 		 209 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  40.78 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  37.93 
 
 		 890 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  39.09 
 
 		 225 aa  72  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  40.68 
 
 		 217 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  28.95 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  39.22 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.57 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  40.4 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  36.52 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  33.33 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  40.2 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  38.33 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  38.32 
 
 		 640 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  39.5 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3624  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0928297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  33.03 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  28.42 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  36.94 
 
 		 694 aa  70.1  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  37.38 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  38.1 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  42.7 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4333  porin  35.83 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 576 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  28.42 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>