More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0237 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0237  OmpA/MotB  100 
 
 		 170 aa  340  5.999999999999999e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.064428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2223  OmpA/MotB  45.14 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  43.83 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3844  putative outer membrane lipoprotein  39.76 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00547019  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1069  OmpA/MotB domain protein  39.39 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000483624  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02494  predicted outer membrane lipoprotein  39.39 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02458  hypothetical protein  39.39 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0788684  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2757  putative outer membrane lipoprotein  38.79 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.116959  decreased coverage  0.00399171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2764  putative outer membrane lipoprotein  39.39 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000137509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2889  putative outer membrane lipoprotein  39.39 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00115542  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1078  putative outer membrane lipoprotein  39.39 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0037573  hitchhiker  0.00684711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0672  OmpA/MotB domain-containing protein  40.13 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  40 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3488  ompA family protein  36.42 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0821  ompA family protein  36.42 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  36.42 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  40.67 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4669  OmpA/MotB domain protein  39.1 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4667  OmpA/MotB domain-containing protein  40.14 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.153114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4533  OmpA/MotB domain-containing protein  40.43 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  41.13 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  39.44 
 
 		 166 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0765  OmpA/MotB domain-containing protein  40.43 
 
 		 163 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.887252  normal  0.0864021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3484  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  45.69 
 
 		 215 aa  94  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5258  OmpA/MotB domain-containing protein  37.41 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  46.85 
 
 		 219 aa  91.7  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3618  OmpA/MotB domain-containing protein  36.99 
 
 		 185 aa  91.3  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3341  OmpA/MotB  36.73 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5026  OmpA/MotB domain-containing protein  36.73 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11353  normal  0.0977146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  38.17 
 
 		 224 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2448  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 221 aa  84.3  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0645  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.23 
 
 		 169 aa  84.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623294  normal  0.92599 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4955  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.782858 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4435  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0232251  hitchhiker  0.000146268 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  40.34 
 
 		 228 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  40.34 
 
 		 228 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  41.18 
 
 		 228 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  42.59 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  35.07 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  36.94 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.46 
 
 		 607 aa  74.3  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 		 236 aa  74.3  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  41.07 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  36.94 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  37.61 
 
 		 499 aa  72.8  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  35.14 
 
 		 220 aa  72  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  35.14 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  38.1 
 
 		 356 aa  72  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  40.91 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  40.54 
 
 		 222 aa  72  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  37.84 
 
 		 230 aa  72  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  34.82 
 
 		 294 aa  71.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  40.68 
 
 		 401 aa  71.2  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  33.07 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  32.53 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1985  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 248 aa  70.9  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  41.59 
 
 		 226 aa  70.9  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  36.94 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  36.7 
 
 		 367 aa  70.9  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  40.21 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  40.21 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4248  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000908263  unclonable  0.0000000127118 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0019  putative outer membrane lipoprotein  35.14 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  34.11 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3787  putative outer membrane lipoprotein  35.14 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4135  putative outer membrane lipoprotein  35.14 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4097  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386824  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  34.23 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  50.68 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  37.84 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  38.94 
 
 		 394 aa  68.9  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  35.83 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1489  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00664745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  34.82 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  37.37 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  39.18 
 
 		 319 aa  68.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  35.09 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  52.24 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  46.67 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  38.94 
 
 		 392 aa  68.6  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  34.23 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3969  OmpA family protein  33.33 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  33.93 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  39.45 
 
 		 478 aa  68.2  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  33.59 
 
 		 429 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  37.37 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  36.04 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>