More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3892 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3892  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 365 aa  731    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.309252  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  44.07 
 
 		 560 aa  83.6  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  34.02 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2839  OmpA/MotB domain protein  42.74 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  41.44 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 239 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1564  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  35.42 
 
 		 521 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432522  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1794  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 264 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5365  OmpA/MotB domain protein  36.42 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.887949 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3216  OmpA/MotB domain-containing protein  36.15 
 
 		 176 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1782  OmpA/MotB domain-containing protein  39.45 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000133592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  35.29 
 
 		 638 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1860  OmpA/MotB domain protein  28.53 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.012973  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  38.53 
 
 		 240 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  38.46 
 
 		 331 aa  67  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1463  OmpA/MotB domain protein  31.18 
 
 		 193 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.373103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2281  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  35.09 
 
 		 356 aa  67  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1203  OmpA/MotB domain-containing protein  33.67 
 
 		 193 aa  67  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.232705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  38.14 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.98 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4096  OmpA/MotB domain protein  34.9 
 
 		 180 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287994  normal  0.208215 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2314  OmpA/MotB domain protein  40.19 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104336  normal  0.160283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7252  OmpA/MotB domain-containing protein  35.16 
 
 		 200 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134508  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  33.33 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  35.48 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  38.14 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  40.5 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  36.22 
 
 		 271 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 		 499 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  30.54 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  34.86 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.45 
 
 		 220 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  33.57 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  36.54 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  36.45 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2675  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.242946  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0281  OmpA/MotB  34.86 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.195682 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  35.96 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  31.09 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1468  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.831013  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  35.51 
 
 		 630 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  37.04 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  37.4 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  34.78 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  30.05 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  34.68 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  30.36 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.62 
 
 		 707 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3597  OmpA/MotB  37.72 
 
 		 193 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  36.11 
 
 		 231 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  33.59 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  38.94 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  34.96 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  29.71 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12471  hypothetical protein  37.72 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  33.94 
 
 		 617 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  37.39 
 
 		 338 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  35.48 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  32.2 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0704  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  32.84 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6457  OmpA/MotB domain-containing protein  39.67 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  30.25 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  35.65 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  35.04 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1672  OmpA/MotB domain protein  32.85 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303989 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  29.73 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000829076  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2341  hypothetical protein  36.04 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.616476  normal  0.556458 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  37.17 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  34.96 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  30.43 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  38.39 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  35.77 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  36.54 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  30.63 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  29.61 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  35.77 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  33.61 
 
 		 658 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  38.39 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  36.61 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1262  OmpA/MotB  36.19 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41140  OmpA family protein  31.73 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>