More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0603 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0603  OmpA family protein  100 
 
 		 207 aa  435  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001456  protein F-related protein  39.81 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05392  hypothetical protein  37.68 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0587  outer membrane protein, OmpA family  30.52 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  39.39 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02060  hypothetical protein  39.39 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0815  putative lipoprotein  39.39 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0753  outer membrane protein, OmpA family  37.4 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  45.37 
 
 		 498 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  38.52 
 
 		 510 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  43.64 
 
 		 345 aa  89  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  35.71 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  43.27 
 
 		 352 aa  85.5  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0621  putative outer membrane protein, OmpA family  39.82 
 
 		 185 aa  84.7  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  37.27 
 
 		 653 aa  84.7  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  35.86 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  37.14 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  44.55 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  44.55 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0280  OmpA/MotB domain-containing protein  39.01 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0488759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  42.73 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 543 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1825  fibronectin-binding protein  39.42 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000112417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  41.12 
 
 		 487 aa  82  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  37.14 
 
 		 617 aa  81.6  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  42.31 
 
 		 348 aa  81.3  0.000000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  40.95 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  40.95 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  40.95 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.81 
 
 		 542 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 1026 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  41.51 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 537 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  40.95 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  40.95 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1651  fibronectin-binding protein  43.96 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  35.88 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  40.95 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  40.95 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  37.59 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  43.14 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1471  fibronectin-binding protein  43.96 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000479334  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 544 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1638  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  44.66 
 
 		 337 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  38.06 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  43.69 
 
 		 337 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  42.42 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  38.38 
 
 		 364 aa  78.6  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  40 
 
 		 311 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0318  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0137068 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  36.61 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 638 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  36.17 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  30.41 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0745121  normal  0.85361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  37.12 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  43.33 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0172  putative outer membrane lipoprotein  35.04 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2322  OmpA/MotB domain-containing protein  35.88 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351877 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  38.1 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.64 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  39.6 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 623 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.64 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  39.09 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  51.39 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  36.04 
 
 		 525 aa  75.9  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0062  putative outer membrane lipoprotein  38.6 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  38.68 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  39 
 
 		 707 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.68 
 
 		 320 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  51.39 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  51.39 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2054  lipoprotein PG3  37.93 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0950809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  38.68 
 
 		 316 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  32.45 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  38.61 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  44.05 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.04 
 
 		 351 aa  74.7  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  31.85 
 
 		 509 aa  74.7  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  51.39 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  45.45 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  39.6 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  33.59 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  39.09 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>